More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1260 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
357 aa  725    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.01 
 
 
358 aa  497  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.49 
 
 
363 aa  433  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.94 
 
 
362 aa  425  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.87 
 
 
350 aa  421  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.49 
 
 
357 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.18 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.07 
 
 
357 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.51 
 
 
352 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.87 
 
 
357 aa  411  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.78 
 
 
371 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.26 
 
 
354 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.34 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.96 
 
 
358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.55 
 
 
352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.62 
 
 
355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.96 
 
 
358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.81 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.46 
 
 
362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.08 
 
 
353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.63 
 
 
359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.76 
 
 
357 aa  401  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.81 
 
 
358 aa  402  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.87 
 
 
351 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.62 
 
 
359 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.44 
 
 
356 aa  401  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.93 
 
 
371 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1920  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.03 
 
 
353 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.97 
 
 
362 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.65 
 
 
360 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0603  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.65 
 
 
353 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.3 
 
 
358 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.91 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.87 
 
 
358 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0850  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.24 
 
 
352 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.898844  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.18 
 
 
364 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.91 
 
 
355 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.19 
 
 
360 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.65 
 
 
360 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.37 
 
 
355 aa  397  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.21 
 
 
356 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.81 
 
 
361 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.31 
 
 
357 aa  396  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.81 
 
 
361 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.37 
 
 
360 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.37 
 
 
360 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.34 
 
 
355 aa  391  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.72 
 
 
367 aa  391  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.49 
 
 
359 aa  394  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.06 
 
 
357 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.43 
 
 
353 aa  391  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.93 
 
 
362 aa  394  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 
360 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 
360 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.3 
 
 
354 aa  391  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.08 
 
 
360 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2147  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.33 
 
 
370 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377914  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.3 
 
 
354 aa  391  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 
360 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4403  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.55 
 
 
360 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.61 
 
 
359 aa  388  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.48 
 
 
357 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.93 
 
 
357 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3775  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.33 
 
 
358 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 
357 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.75 
 
 
356 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.62 
 
 
358 aa  386  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.65 
 
 
357 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.78 
 
 
362 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2131  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.32 
 
 
355 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.609597  normal  0.0221523 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.06 
 
 
373 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29616  predicted protein  56.21 
 
 
361 aa  384  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.09 
 
 
361 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.93 
 
 
360 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.08 
 
 
360 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0908  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.42 
 
 
362 aa  378  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0378851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2879  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.87 
 
 
362 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.09 
 
 
359 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17341  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 
357 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1904  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.21 
 
 
365 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000997715  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.68 
 
 
357 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.14 
 
 
357 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.83 
 
 
363 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.24 
 
 
360 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1045  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.87 
 
 
362 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.18231  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2917  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.98 
 
 
364 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.95 
 
 
356 aa  378  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.81 
 
 
357 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.09 
 
 
356 aa  379  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0045  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.14 
 
 
362 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146911  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.37 
 
 
357 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.81 
 
 
359 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2987  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.26 
 
 
362 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.372327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.59 
 
 
362 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000206723  normal  0.0345378 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1505  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.06 
 
 
365 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0654454  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0391  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.66 
 
 
358 aa  375  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.25 
 
 
355 aa  375  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.04 
 
 
356 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3353  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.14 
 
 
362 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.133211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.12 
 
 
373 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>