More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0688 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  95.58 
 
 
339 aa  665    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  95.87 
 
 
339 aa  667    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  100 
 
 
339 aa  691    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  81.9 
 
 
337 aa  568  1e-161  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  67.36 
 
 
343 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  50.29 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.63 
 
 
360 aa  315  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.65 
 
 
334 aa  312  5.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  49.56 
 
 
330 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  48.68 
 
 
330 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  49.56 
 
 
330 aa  309  5e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.33 
 
 
335 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  47.81 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.62 
 
 
333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.26 
 
 
362 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  49.39 
 
 
323 aa  293  3e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.97 
 
 
326 aa  291  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.14 
 
 
331 aa  289  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.84 
 
 
332 aa  288  8e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  43.03 
 
 
335 aa  275  9e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.76 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.08 
 
 
329 aa  273  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  42.73 
 
 
335 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  42.43 
 
 
336 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  42.43 
 
 
336 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  42.43 
 
 
336 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  42.43 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  42.43 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  42.43 
 
 
336 aa  269  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  42.44 
 
 
340 aa  268  8e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.35 
 
 
348 aa  268  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  43.03 
 
 
335 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  43.03 
 
 
335 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  41.72 
 
 
335 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  43.03 
 
 
335 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  41.84 
 
 
336 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  42.43 
 
 
336 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  43.03 
 
 
335 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  44.41 
 
 
360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  42.18 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  42.14 
 
 
335 aa  265  8e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  42.77 
 
 
335 aa  265  1e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  42.77 
 
 
335 aa  265  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  41.72 
 
 
335 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.36 
 
 
334 aa  263  2e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.88 
 
 
326 aa  264  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.15 
 
 
338 aa  263  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.13 
 
 
370 aa  264  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  43.15 
 
 
344 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.58 
 
 
331 aa  262  6e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  42.73 
 
 
336 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.38 
 
 
333 aa  260  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  42.23 
 
 
370 aa  261  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.08 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  43.38 
 
 
377 aa  259  6e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.82 
 
 
337 aa  257  2e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  42.98 
 
 
348 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  42.73 
 
 
335 aa  256  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.42 
 
 
334 aa  255  9e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.75 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  42.14 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.54 
 
 
342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2380  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  43.19 
 
 
344 aa  252  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.07 
 
 
335 aa  250  2e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  42.61 
 
 
345 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.88 
 
 
335 aa  251  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.2 
 
 
326 aa  248  8e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.86 
 
 
322 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.92 
 
 
343 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  39.89 
 
 
615 aa  246  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.45 
 
 
361 aa  243  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.64 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  40.77 
 
 
336 aa  242  7.999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3205  dehydrogenase, isocitrate/isopropylmalate family  36.36 
 
 
396 aa  241  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0643665  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  39.5 
 
 
615 aa  242  9e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  42.56 
 
 
334 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.29 
 
 
343 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.21 
 
 
336 aa  240  2e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  41.42 
 
 
335 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.58 
 
 
336 aa  241  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.34 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.45 
 
 
364 aa  239  5e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.52 
 
 
360 aa  239  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.67 
 
 
331 aa  238  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.07 
 
 
325 aa  238  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3071  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.08 
 
 
396 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.39 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  41.11 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.76 
 
 
358 aa  233  3e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.06 
 
 
358 aa  233  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.18 
 
 
325 aa  232  6e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.11 
 
 
356 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.48 
 
 
325 aa  229  4e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2964  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.98 
 
 
403 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41 
 
 
361 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.11 
 
 
346 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.6 
 
 
343 aa  226  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.53 
 
 
327 aa  225  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  37.99 
 
 
356 aa  225  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  36.74 
 
 
359 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>