More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0602 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
325 aa  657    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.19 
 
 
322 aa  393  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.31 
 
 
329 aa  389  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.49 
 
 
321 aa  375  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.31 
 
 
336 aa  361  9e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.42 
 
 
338 aa  346  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  50.94 
 
 
323 aa  323  4e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.88 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.37 
 
 
330 aa  265  7e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.07 
 
 
330 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  42.77 
 
 
330 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.47 
 
 
332 aa  255  8e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.95 
 
 
334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.55 
 
 
331 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  41.87 
 
 
330 aa  253  3e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.42 
 
 
335 aa  251  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.07 
 
 
337 aa  250  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.34 
 
 
333 aa  247  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.64 
 
 
335 aa  246  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  40.55 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.73 
 
 
339 aa  242  6e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.73 
 
 
339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.12 
 
 
370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.34 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.37 
 
 
343 aa  239  4e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.19 
 
 
362 aa  239  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.3 
 
 
326 aa  237  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.94 
 
 
360 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.99 
 
 
331 aa  236  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  39 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.27 
 
 
336 aa  233  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  40.83 
 
 
370 aa  232  7.000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  39.66 
 
 
360 aa  228  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.06 
 
 
334 aa  227  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.37 
 
 
331 aa  223  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.09 
 
 
342 aa  223  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.53 
 
 
335 aa  222  8e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  38.24 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  38.48 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  40.18 
 
 
335 aa  219  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  40.53 
 
 
340 aa  219  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  39.27 
 
 
335 aa  218  8.999999999999998e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  40.3 
 
 
335 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  39.34 
 
 
335 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  39.4 
 
 
335 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  38.79 
 
 
335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  39.27 
 
 
336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  39.1 
 
 
335 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  38.48 
 
 
335 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  38.81 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  38.79 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  38.79 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.08 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  38.79 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  38.79 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.34 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  39.7 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.64 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  37.69 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  38.79 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  38.76 
 
 
370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  38.79 
 
 
336 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.24 
 
 
336 aa  212  9e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  38.48 
 
 
336 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  38.48 
 
 
336 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  38.48 
 
 
336 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.46 
 
 
352 aa  210  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.08 
 
 
356 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1033  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.94 
 
 
351 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895977  hitchhiker  0.00144137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.9 
 
 
361 aa  210  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  38.48 
 
 
335 aa  209  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.39 
 
 
334 aa  209  4e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2804  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.75 
 
 
359 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  39.47 
 
 
349 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.95 
 
 
348 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.64 
 
 
357 aa  205  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.64 
 
 
359 aa  205  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14420  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  38.75 
 
 
356 aa  205  9e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404223  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  38.07 
 
 
352 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  34.46 
 
 
359 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.64 
 
 
361 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2611  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.81 
 
 
360 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0404939  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  34.65 
 
 
359 aa  203  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  38.18 
 
 
336 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  40.06 
 
 
360 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.92 
 
 
355 aa  202  5e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.99 
 
 
357 aa  202  5e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.62 
 
 
345 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.2 
 
 
357 aa  202  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.52 
 
 
326 aa  202  7e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  40.06 
 
 
360 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2572  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.81 
 
 
360 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2617  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.81 
 
 
360 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  38.07 
 
 
385 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2147  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.61 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377914  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.57 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  36 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6847  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.33 
 
 
355 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0118477  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00816  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.96 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.08 
 
 
352 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0498293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>