More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0088 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 336 aa  683    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  73.41 
 
 		 336 aa  511  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  56.07 
 
 		 335 aa  349  3e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  47.49 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.47 
 
 		 325 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.59 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.71 
 
 		 325 aa  295  8e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.16 
 
 		 325 aa  295  9e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.7 
 
 		 335 aa  280  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.4 
 
 		 334 aa  279  6e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  43.02 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  43.36 
 
 		 336 aa  272  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.28 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.44 
 
 		 331 aa  265  7e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.62 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.32 
 
 		 330 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  41.69 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.81 
 
 		 330 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  40 
 
 		 326 aa  252  5.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  40.64 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.52 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  40.8 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.19 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.59 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.3 
 
 		 326 aa  247  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  40.76 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  40.18 
 
 		 335 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  40.18 
 
 		 335 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  40.18 
 
 		 335 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  40.18 
 
 		 335 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  40.06 
 
 		 336 aa  242  7e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  40.06 
 
 		 336 aa  242  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.58 
 
 		 339 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  40.35 
 
 		 336 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  40.18 
 
 		 335 aa  241  9e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  40.06 
 
 		 336 aa  241  9e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  39.53 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  39.77 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  40.18 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  40.18 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.25 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.58 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.11 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  39.88 
 
 		 336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  39.88 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  40.94 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.06 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  40.18 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  39.71 
 
 		 339 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  39.88 
 
 		 335 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.42 
 
 		 333 aa  238  9e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.42 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.7 
 
 		 333 aa  238  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  40.94 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  41 
 
 		 362 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  41.52 
 
 		 335 aa  237  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  41.52 
 
 		 335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.69 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.58 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.42 
 
 		 331 aa  232  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  39.24 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.46 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  38.24 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  38.52 
 
 		 377 aa  230  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.09 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  39.53 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.06 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  38.59 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.13 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.58 
 
 		 342 aa  229  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.08 
 
 		 334 aa  229  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  38.86 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  40.35 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  38.84 
 
 		 385 aa  224  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  39.88 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1846  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.64 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  37.57 
 
 		 360 aa  223  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0870  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  38.82 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.4 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0498293 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  38.95 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.43 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1073  isocitrate dehydrogenase (NADP)  36.73 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.606358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  39.36 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.74 
 
 		 358 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2488  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.93 
 
 		 377 aa  215  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  37.54 
 
 		 487 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.41 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.12 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  38.3 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  35.68 
 
 		 370 aa  212  9e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.24 
 
 		 325 aa  212  9e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.92 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0623  isocitrate dehydrogenase (NADP)  36.28 
 
 		 342 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2611  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.23 
 
 		 360 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0404939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2617  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.51 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2572  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.51 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2885  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.06 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91057  isocitrate dehydrogenase  37.61 
 
 		 362 aa  206  5e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.433771 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.64 
 
 		 344 aa  206  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>