More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1601 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 352 aa  709    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0498293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1846  3-isopropylmalate dehydrogenase  86.74 
 
 		 350 aa  623  1e-177  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1033  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.73 
 
 		 351 aa  394  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895977  hitchhiker  0.00144137 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.43 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.96 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.27 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0850  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.18 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.898844  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.13 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.03 
 
 		 352 aa  371  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.02 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.11 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.02 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.1 
 
 		 362 aa  368  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  56 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.28 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.17 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.8 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.72 
 
 		 358 aa  364  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.44 
 
 		 352 aa  364  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.79 
 
 		 364 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.4 
 
 		 356 aa  363  3e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.49 
 
 		 358 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.9 
 
 		 357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.87 
 
 		 350 aa  361  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.24 
 
 		 356 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.52 
 
 		 355 aa  359  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0603  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.72 
 
 		 353 aa  360  3e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3130  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.1 
 
 		 355 aa  359  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.462237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.06 
 
 		 357 aa  359  5e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.65 
 
 		 359 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.43 
 
 		 359 aa  358  6e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.67 
 
 		 362 aa  358  6e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.79 
 
 		 357 aa  358  7e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.34 
 
 		 356 aa  358  7e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3760  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.25 
 
 		 364 aa  358  7e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.930795  normal  0.184493 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4235  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.8 
 
 		 364 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.58 
 
 		 353 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3587  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.25 
 
 		 364 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001657  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.11 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0194  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.65 
 
 		 359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18652  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4403  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.67 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0369  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.25 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3819  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.21 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.57 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.17 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00816  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.11 
 
 		 363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.79 
 
 		 357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.86 
 
 		 371 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2162  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.8 
 
 		 363 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.56 
 
 		 353 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.04 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.57 
 
 		 358 aa  354  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.04 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.61 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17341  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.44 
 
 		 357 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.71 
 
 		 353 aa  354  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2917  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.76 
 
 		 364 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2987  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.1 
 
 		 362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.372327 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2066  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.46 
 
 		 363 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3610  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.59 
 
 		 361 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  52 
 
 		 357 aa  352  7e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.94 
 
 		 355 aa  352  8e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.57 
 
 		 360 aa  350  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.82 
 
 		 363 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.13 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.6 
 
 		 358 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1793  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.78 
 
 		 356 aa  350  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0412  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 		 364 aa  349  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.6 
 
 		 358 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0386  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 		 364 aa  349  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  52 
 
 		 360 aa  349  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 360 aa  349  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 371 aa  348  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.07 
 
 		 364 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  52 
 
 		 360 aa  348  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.14 
 
 		 379 aa  348  8e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  52 
 
 		 360 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  52 
 
 		 360 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.47 
 
 		 354 aa  347  1e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.47 
 
 		 354 aa  347  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0398  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047099 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.32 
 
 		 362 aa  347  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2311  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.54 
 
 		 355 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.27 
 
 		 359 aa  347  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  52 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0472  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 		 361 aa  347  1e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.86 
 
 		 357 aa  348  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.15 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0335  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.05 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2472  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.82 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.77 
 
 		 357 aa  346  3e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.82 
 
 		 363 aa  346  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0593  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.41 
 
 		 363 aa  347  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2662  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.18 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  52 
 
 		 351 aa  346  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.27 
 
 		 358 aa  346  4e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0283  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 353 aa  345  8e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0535154  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1677  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.26 
 
 		 367 aa  345  8e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.58 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>