More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2662 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2662  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 369 aa  740    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1085  3-isopropylmalate dehydrogenase  75.85 
 
 		 348 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4494  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.74 
 
 		 346 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.27 
 
 		 356 aa  441  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0767  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.99 
 
 		 356 aa  440  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2131  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.16 
 
 		 355 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.609597  normal  0.0221523 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1643  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.88 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2313  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.88 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.941716  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1852  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.88 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614244  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4627  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.33 
 
 		 355 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.391224  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1726  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.88 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2311  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.6 
 
 		 355 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0523  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.88 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.653046  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0775  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.88 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341042  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3847  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.33 
 
 		 355 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.937841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3576  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.33 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.88 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172832  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.98 
 
 		 359 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2472  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.6 
 
 		 355 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4415  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.33 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6847  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.33 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0118477  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3952  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.33 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.94 
 
 		 363 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0674  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.6 
 
 		 355 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00238259  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2887  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.05 
 
 		 355 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.423656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1819  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.22 
 
 		 356 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7246  normal  0.707373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4369  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.5 
 
 		 355 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3343  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.33 
 
 		 355 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.33 
 
 		 356 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2143  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.94 
 
 		 356 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.33 
 
 		 357 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.77 
 
 		 357 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1793  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.5 
 
 		 356 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.5 
 
 		 351 aa  418  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.22 
 
 		 357 aa  421  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.22 
 
 		 350 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1677  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.66 
 
 		 367 aa  415  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1920  3-isopropylmalate dehydrogenase  60 
 
 		 353 aa  413  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  61 
 
 		 362 aa  411  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.39 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2162  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.11 
 
 		 363 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.73 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  60 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.38 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.47 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.5 
 
 		 353 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.84 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.92 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.2 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3610  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.92 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.47 
 
 		 360 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.3 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.54 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.97 
 
 		 359 aa  381  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.52 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.92 
 
 		 360 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.37 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.37 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.18 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.56 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.21 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.92 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.1 
 
 		 360 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.06 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.1 
 
 		 360 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.78 
 
 		 355 aa  371  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.7 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.06 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.47 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.1 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.7 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.97 
 
 		 362 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.43 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.2 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.43 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.34 
 
 		 373 aa  368  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.1 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.87 
 
 		 379 aa  364  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.44 
 
 		 357 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.5 
 
 		 363 aa  363  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.97 
 
 		 360 aa  362  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.48 
 
 		 358 aa  361  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.61 
 
 		 358 aa  360  2e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.51 
 
 		 356 aa  359  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.4 
 
 		 363 aa  358  9e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.2 
 
 		 359 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.89 
 
 		 357 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.25 
 
 		 357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.39 
 
 		 356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.48 
 
 		 355 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.69 
 
 		 357 aa  353  4e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.61 
 
 		 373 aa  350  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.44 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2259  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.19 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.61 
 
 		 362 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.97 
 
 		 353 aa  350  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3775  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.46 
 
 		 358 aa  349  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.89 
 
 		 358 aa  349  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.67 
 
 		 371 aa  348  7e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 367 aa  348  8e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>