More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1546 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  90.66 
 
 		 367 aa  662    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 373 aa  746    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.11 
 
 		 357 aa  508  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0588  3-isopropylmalate dehydrogenase  76.37 
 
 		 358 aa  503  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.72 
 
 		 373 aa  461  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.9 
 
 		 371 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.66 
 
 		 358 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.17 
 
 		 373 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3336  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.99 
 
 		 353 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.08 
 
 		 371 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.82 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.83 
 
 		 354 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.89 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.86 
 
 		 356 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2070  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.66 
 
 		 353 aa  404  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1807  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.24 
 
 		 353 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.833313  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0745  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.28 
 
 		 365 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000247717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.51 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1886  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.66 
 
 		 353 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.22 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.9 
 
 		 363 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.03 
 
 		 369 aa  395  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.12 
 
 		 357 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.28 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.18 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.62 
 
 		 358 aa  391  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.3 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.23 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.56 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.75 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0826  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.38 
 
 		 365 aa  386  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.92 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_730  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.92 
 
 		 365 aa  386  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000128158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.25 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.92 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.92 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3744  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.22 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.38 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.68 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.44 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.82 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.82 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.1 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.59 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.8 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.4 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.29 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.83 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.76 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.62 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.99 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1304  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 		 351 aa  378  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3548  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.83 
 
 		 341 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.12 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.44 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.55 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.85 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.03 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5898  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.52 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115502  normal  0.433986 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.57 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3671  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.68 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.44 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1793  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.29 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.97 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.72 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.82 
 
 		 359 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.34 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.74 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.18 
 
 		 358 aa  368  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.27 
 
 		 356 aa  368  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.14 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.22 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.42 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.18 
 
 		 358 aa  368  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.7 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.74 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.07 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.7 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.22 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.1 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.51 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.8 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2131  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.82 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.609597  normal  0.0221523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.01 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.52 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.89 
 
 		 357 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.3 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0767  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.27 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2147  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.24 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377914  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.74 
 
 		 367 aa  363  3e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.62 
 
 		 379 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6847  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.34 
 
 		 355 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0118477  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2864  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.6 
 
 		 372 aa  363  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.020128  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1726  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0775  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341042  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172832  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1852  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614244  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0523  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.653046  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1643  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>