More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2864 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2864  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
372 aa  752    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.020128  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3744  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.82 
 
 
360 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1304  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.9 
 
 
351 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3428  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.01 
 
 
352 aa  396  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.36 
 
 
356 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.46 
 
 
363 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.93 
 
 
359 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3671  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.86 
 
 
356 aa  371  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 
362 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.43 
 
 
371 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.73 
 
 
367 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.22 
 
 
356 aa  363  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.15 
 
 
371 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.6 
 
 
373 aa  363  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.69 
 
 
357 aa  361  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5898  3-isopropylmalate dehydrogenase  52 
 
 
358 aa  360  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115502  normal  0.433986 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.56 
 
 
358 aa  360  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.86 
 
 
355 aa  358  6e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.81 
 
 
373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.25 
 
 
369 aa  352  7e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3336  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.52 
 
 
353 aa  350  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.99 
 
 
359 aa  347  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2917  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.57 
 
 
364 aa  347  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.42 
 
 
352 aa  346  3e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.56 
 
 
355 aa  344  2e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.86 
 
 
373 aa  343  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.44 
 
 
355 aa  342  4e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.43 
 
 
358 aa  342  9e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.84 
 
 
360 aa  341  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.42 
 
 
358 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.42 
 
 
357 aa  341  1e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.43 
 
 
362 aa  340  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.3 
 
 
358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.3 
 
 
358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.14 
 
 
357 aa  339  5.9999999999999996e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.44 
 
 
357 aa  338  8e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.98 
 
 
357 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.58 
 
 
364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.25 
 
 
354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.69 
 
 
355 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3548  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.56 
 
 
341 aa  335  5e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1886  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.38 
 
 
353 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1807  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.38 
 
 
353 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.833313  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 
356 aa  335  7e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.56 
 
 
353 aa  335  9e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.56 
 
 
357 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2070  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.08 
 
 
353 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 
360 aa  333  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.42 
 
 
351 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.42 
 
 
350 aa  332  9e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.04 
 
 
357 aa  331  1e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 
360 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.57 
 
 
352 aa  330  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.3 
 
 
358 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 
360 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.7 
 
 
356 aa  329  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.7 
 
 
361 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.7 
 
 
361 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0745  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.35 
 
 
365 aa  329  6e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000247717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 
360 aa  329  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0588  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.98 
 
 
358 aa  329  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.57 
 
 
360 aa  328  8e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04390  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.89 
 
 
375 aa  328  9e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.930022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 
356 aa  328  9e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.28 
 
 
354 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.15 
 
 
356 aa  327  1.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.28 
 
 
354 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.04 
 
 
357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.85 
 
 
358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.15 
 
 
360 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.44 
 
 
360 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0603  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.61 
 
 
353 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0850  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.71 
 
 
352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.898844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0597  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.99 
 
 
523 aa  325  6e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000598819  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 
354 aa  325  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1492  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.6 
 
 
354 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.43 
 
 
352 aa  324  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1312  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.6 
 
 
354 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1285  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.6 
 
 
354 aa  323  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.09 
 
 
353 aa  324  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1421  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.6 
 
 
354 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.74 
 
 
357 aa  324  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.29 
 
 
360 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 
363 aa  322  5e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.18 
 
 
356 aa  322  6e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3890  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.85 
 
 
354 aa  322  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1521  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.3 
 
 
354 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1286  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.3 
 
 
354 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.53 
 
 
362 aa  320  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1454  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.85 
 
 
354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3130  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.55 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.462237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 
355 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.44 
 
 
360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1560  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 
354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.59 
 
 
360 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.55 
 
 
352 aa  319  6e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.59 
 
 
360 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.59 
 
 
360 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.43 
 
 
353 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 
357 aa  318  9e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>