More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04390 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04390  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 375 aa  754    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.930022 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.3 
 
 		 369 aa  466  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.02 
 
 		 362 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.46 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.91 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.79 
 
 		 357 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.37 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.26 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.49 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.62 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.04 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.1 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.62 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.51 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.6 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5898  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.65 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115502  normal  0.433986 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.62 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.13 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.85 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.83 
 
 		 363 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.02 
 
 		 352 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.8 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.53 
 
 		 352 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.77 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.4 
 
 		 358 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.18 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.3 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.54 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3671  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 356 aa  363  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.92 
 
 		 357 aa  363  3e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.01 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.59 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.44 
 
 		 353 aa  360  3e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3548  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.61 
 
 		 341 aa  360  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.18 
 
 		 357 aa  359  4e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.55 
 
 		 360 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.43 
 
 		 360 aa  358  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.33 
 
 		 373 aa  358  8e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3775  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.8 
 
 		 358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.99 
 
 		 362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.68 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0745  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.08 
 
 		 365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000247717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.74 
 
 		 357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.35 
 
 		 373 aa  356  3.9999999999999996e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.03 
 
 		 353 aa  355  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.51 
 
 		 362 aa  354  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.67 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.91 
 
 		 359 aa  353  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.65 
 
 		 359 aa  353  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.55 
 
 		 360 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.89 
 
 		 360 aa  352  5e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.62 
 
 		 357 aa  352  5e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.92 
 
 		 360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.61 
 
 		 360 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.33 
 
 		 360 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.92 
 
 		 361 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.4 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.93 
 
 		 373 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.92 
 
 		 361 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.2 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.2 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.85 
 
 		 357 aa  350  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.27 
 
 		 355 aa  350  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.66 
 
 		 359 aa  348  7e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.41 
 
 		 364 aa  348  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.48 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.61 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.48 
 
 		 360 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.48 
 
 		 360 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.97 
 
 		 356 aa  346  3e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.68 
 
 		 359 aa  346  4e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.09 
 
 		 355 aa  346  4e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.24 
 
 		 360 aa  345  6e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1920  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.38 
 
 		 353 aa  345  7e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.2 
 
 		 357 aa  345  7e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.65 
 
 		 351 aa  345  7e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.33 
 
 		 357 aa  345  1e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.94 
 
 		 357 aa  345  1e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.93 
 
 		 354 aa  344  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.94 
 
 		 357 aa  343  2e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.16 
 
 		 352 aa  343  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.93 
 
 		 354 aa  344  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.17 
 
 		 352 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 358 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0376  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.86 
 
 		 363 aa  343  4e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.94 
 
 		 379 aa  342  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.81 
 
 		 362 aa  342  5e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.96 
 
 		 357 aa  342  5e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1934  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.68 
 
 		 367 aa  342  7e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00816  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.27 
 
 		 363 aa  342  9e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.68 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.86 
 
 		 359 aa  341  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0850  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.56 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.898844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.55 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1505  3-isopropylmalate dehydrogenase  55 
 
 		 365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0654454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2066  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.15 
 
 		 363 aa  339  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001657  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 363 aa  339  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3428  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.59 
 
 		 352 aa  338  7e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17341  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 		 357 aa  338  8e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.53 
 
 		 359 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>