More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3671 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3671  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 356 aa  724    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5898  3-isopropylmalate dehydrogenase  78.93 
 
 		 358 aa  592  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115502  normal  0.433986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.16 
 
 		 359 aa  539  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1304  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.49 
 
 		 351 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3428  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.69 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3744  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.76 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.27 
 
 		 373 aa  378  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.75 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.06 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.46 
 
 		 358 aa  376  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.81 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2864  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.86 
 
 		 372 aa  371  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.020128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.68 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.14 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.08 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.42 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.89 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.01 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.91 
 
 		 357 aa  364  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.12 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 357 aa  363  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.71 
 
 		 358 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.56 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.69 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.95 
 
 		 356 aa  359  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.12 
 
 		 357 aa  359  5e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.14 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  51 
 
 		 355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.57 
 
 		 352 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.1 
 
 		 355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.22 
 
 		 363 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 356 aa  355  8.999999999999999e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.24 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.1 
 
 		 373 aa  353  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04390  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 375 aa  350  3e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.930022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 		 360 aa  348  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 		 360 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 		 360 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 354 aa  348  8e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.43 
 
 		 355 aa  347  1e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1085  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.35 
 
 		 348 aa  348  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.71 
 
 		 350 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.63 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.45 
 
 		 360 aa  346  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 		 360 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.93 
 
 		 360 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.88 
 
 		 359 aa  345  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.45 
 
 		 357 aa  345  8e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.24 
 
 		 359 aa  344  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 352 aa  344  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 		 357 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.06 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.51 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2070  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.5 
 
 		 353 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3548  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.34 
 
 		 341 aa  342  5e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.59 
 
 		 363 aa  342  5e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1886  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.22 
 
 		 353 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1807  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.22 
 
 		 353 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.833313  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.44 
 
 		 379 aa  342  7e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.58 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.39 
 
 		 354 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0767  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0850  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.43 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.898844  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.03 
 
 		 357 aa  339  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 		 357 aa  339  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.92 
 
 		 360 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 		 362 aa  339  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.88 
 
 		 357 aa  338  7e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.86 
 
 		 353 aa  338  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.56 
 
 		 353 aa  338  7e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.46 
 
 		 357 aa  338  8e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 		 356 aa  337  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.92 
 
 		 362 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.44 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1170  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.15 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.92 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.8 
 
 		 367 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.45 
 
 		 359 aa  335  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.1 
 
 		 357 aa  336  5e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.59 
 
 		 357 aa  335  7.999999999999999e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 		 357 aa  334  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.16 
 
 		 357 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2472  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 		 355 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.48 
 
 		 343 aa  334  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.9 
 
 		 356 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2311  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.44 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.87 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.87 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3336  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.7 
 
 		 353 aa  332  4e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.47 
 
 		 360 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2917  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.42 
 
 		 364 aa  332  8e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0588  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.24 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.8 
 
 		 362 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.25 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.18 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4494  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.19 
 
 		 352 aa  330  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>