More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0585 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 369 aa  744    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04390  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.3 
 
 		 375 aa  456  1e-127  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.930022 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.04 
 
 		 362 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.08 
 
 		 357 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.86 
 
 		 352 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.92 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3548  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.89 
 
 		 341 aa  401  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.38 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.13 
 
 		 358 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.97 
 
 		 356 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.53 
 
 		 354 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.74 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.92 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.22 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.03 
 
 		 373 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.87 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.08 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.15 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.55 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.15 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.84 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.68 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.18 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5898  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.22 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115502  normal  0.433986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.79 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.15 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.57 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.95 
 
 		 361 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.3 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.3 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.59 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.95 
 
 		 361 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.15 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.25 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0045  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.42 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146911  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.16 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.31 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.95 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.57 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000206723  normal  0.0345378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0908  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.96 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0378851  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.2 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.49 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.35 
 
 		 373 aa  388  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2879  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.03 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.76 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.88 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1904  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.69 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000997715  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.28 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3353  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.69 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.133211 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.28 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.28 
 
 		 362 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3671  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.75 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.7 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.78 
 
 		 362 aa  381  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.49 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.62 
 
 		 363 aa  378  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.47 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1045  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.76 
 
 		 362 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.18231  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.53 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3775  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.07 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.71 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0348  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.08 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000128786  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.88 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.1 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.31 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.13 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.68 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.86 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.59 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.16 
 
 		 357 aa  375  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.97 
 
 		 352 aa  371  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2987  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.68 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.372327 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.04 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1505  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.22 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0654454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.19 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.34 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.02 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0767  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.71 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0391  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.64 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.15 
 
 		 371 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.89 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.13 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.59 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.77 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1726  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.59 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0775  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.59 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341042  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2131  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.13 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.609597  normal  0.0221523 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1852  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.59 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614244  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3847  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.31 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.937841 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0523  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.59 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.653046  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0785  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.26 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.537709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1643  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.59 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.62 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.41 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.3 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3343  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.04 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2313  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.59 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.941716  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.46 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>