More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1020 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
356 aa  723    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  80.56 
 
 
356 aa  593  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  78.31 
 
 
355 aa  588  1e-167  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  78.59 
 
 
355 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.39 
 
 
357 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.89 
 
 
355 aa  513  1e-144  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.99 
 
 
358 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.3 
 
 
357 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.87 
 
 
358 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  60 
 
 
352 aa  413  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.15 
 
 
355 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.56 
 
 
362 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.51 
 
 
360 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.5 
 
 
357 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.65 
 
 
362 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.39 
 
 
358 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.82 
 
 
363 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.59 
 
 
356 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.7 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.51 
 
 
360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.99 
 
 
371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.22 
 
 
360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.35 
 
 
362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.04 
 
 
357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.81 
 
 
357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.89 
 
 
353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.7 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.65 
 
 
360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.52 
 
 
360 aa  401  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.7 
 
 
357 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.41 
 
 
360 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0194  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.43 
 
 
359 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18652  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.57 
 
 
357 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.44 
 
 
364 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.37 
 
 
354 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.56 
 
 
360 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.43 
 
 
359 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.07 
 
 
353 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.9 
 
 
362 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  56 
 
 
352 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0794  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.42 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.86487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.11 
 
 
360 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.21 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.21 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.58 
 
 
362 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0850  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.62 
 
 
352 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.898844  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.18 
 
 
357 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.45 
 
 
350 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.96 
 
 
358 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.94 
 
 
360 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.81 
 
 
357 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.7 
 
 
360 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.26 
 
 
357 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3775  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.9 
 
 
358 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0603  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.76 
 
 
353 aa  392  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.65 
 
 
353 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.43 
 
 
357 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.02 
 
 
358 aa  391  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.27 
 
 
356 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.46 
 
 
379 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.14 
 
 
355 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.28 
 
 
360 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.7 
 
 
358 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0391  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.62 
 
 
358 aa  392  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.7 
 
 
358 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.49 
 
 
357 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.25 
 
 
369 aa  390  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.46 
 
 
362 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.44 
 
 
371 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.49 
 
 
359 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.26 
 
 
360 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.49 
 
 
359 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.26 
 
 
357 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.71 
 
 
361 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.14 
 
 
357 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1677  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.08 
 
 
367 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.96 
 
 
356 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.49 
 
 
357 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.91 
 
 
352 aa  386  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17341  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.2 
 
 
357 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0597  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.34 
 
 
523 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000598819  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1793  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.44 
 
 
356 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.28 
 
 
363 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.14 
 
 
357 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.35 
 
 
373 aa  381  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.47 
 
 
357 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0767  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.49 
 
 
356 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07951  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.78 
 
 
357 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.79 
 
 
359 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.34 
 
 
359 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.52 
 
 
356 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.13 
 
 
351 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.77 
 
 
356 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0908  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.93 
 
 
362 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0378851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2879  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 
362 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.72 
 
 
367 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1920  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.44 
 
 
353 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2987  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.68 
 
 
362 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.372327 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.09 
 
 
357 aa  379  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.56 
 
 
359 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>