More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0194 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0194  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 359 aa  734    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18652  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  98.89 
 
 		 359 aa  725    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.53 
 
 		 357 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.05 
 
 		 360 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17341  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.53 
 
 		 357 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1865  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.69 
 
 		 357 aa  477  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0794  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.41 
 
 		 357 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.86487  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07951  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.29 
 
 		 357 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.84 
 
 		 361 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.84 
 
 		 361 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.72 
 
 		 364 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.28 
 
 		 362 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1505  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.67 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0654454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.33 
 
 		 362 aa  443  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08471  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.06 
 
 		 357 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.363637  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08501  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.49 
 
 		 357 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.713362  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4403  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.85 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29616  predicted protein  57.54 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2987  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.89 
 
 		 362 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.372327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.13 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.18 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.62 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.34 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.34 
 
 		 357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20934  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.42 
 
 		 416 aa  402  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.74 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.37 
 
 		 351 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.43 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.43 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.53 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.49 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.78 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.82 
 
 		 362 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.11 
 
 		 357 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.9 
 
 		 357 aa  394  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.99 
 
 		 357 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.87 
 
 		 358 aa  391  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.79 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.34 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.72 
 
 		 355 aa  389  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.79 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.53 
 
 		 359 aa  388  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.99 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.23 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.79 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1920  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.72 
 
 		 353 aa  385  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1934  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.06 
 
 		 367 aa  385  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.96 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.5 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.07 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.01 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2311  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.39 
 
 		 355 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.23 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.57 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.93 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2887  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.48 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.423656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2472  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.96 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.23 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.34 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6847  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.2 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0118477  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.06 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2131  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.48 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.609597  normal  0.0221523 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.83 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.86 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.78 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.84 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.97 
 
 		 357 aa  381  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1571  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.34 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.79 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.26 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.33 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3847  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.92 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.937841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3576  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.2 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0767  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.61 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.82 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.85 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.41 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4415  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.2 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4369  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.26 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3343  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.92 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3952  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.2 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.92 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1643  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.92 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1819  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.2 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7246  normal  0.707373 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.92 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172832  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1726  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.92 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.97 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.37 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.38 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0775  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.92 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341042  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.81 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2313  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.92 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.941716  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0674  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.92 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00238259  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0523  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.92 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.653046  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4627  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.92 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.391224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1852  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.92 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614244  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.63 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.65 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>