More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0738 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 358 aa  740    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0850  3-isopropylmalate dehydrogenase  86.08 
 
 		 352 aa  634  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.898844  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0603  3-isopropylmalate dehydrogenase  84.94 
 
 		 353 aa  627  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  84.9 
 
 		 352 aa  629  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  85.39 
 
 		 352 aa  622  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  80.29 
 
 		 353 aa  597  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  79.14 
 
 		 353 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.3 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.18 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.44 
 
 		 357 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.7 
 
 		 357 aa  409  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.46 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.06 
 
 		 361 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.06 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.81 
 
 		 357 aa  402  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.32 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.06 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.34 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.18 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.14 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.64 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.93 
 
 		 357 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.62 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.5 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.06 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.62 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1920  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.24 
 
 		 353 aa  391  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.65 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.17 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.54 
 
 		 362 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.21 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.02 
 
 		 356 aa  391  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.08 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.65 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.65 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.68 
 
 		 362 aa  388  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.81 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.8 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.24 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.06 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.24 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0767  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.03 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.24 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.81 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.74 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17341  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.11 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.89 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.93 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.67 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.52 
 
 		 362 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.75 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4403  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.95 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.62 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.34 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.71 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.54 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.39 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.54 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.48 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.26 
 
 		 353 aa  378  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 		 357 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.24 
 
 		 351 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2147  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.78 
 
 		 370 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377914  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.91 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.55 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.23 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2987  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.8 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.372327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1904  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.63 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000997715  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1865  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.53 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.39 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1793  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.47 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.65 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.75 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3762  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.91 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.43 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.43 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.31 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.91 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.76 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.82 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3775  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.36 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.85 
 
 		 357 aa  371  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29616  predicted protein  53.31 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0794  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.71 
 
 		 357 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.86487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.65 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.48 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.13 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.09 
 
 		 367 aa  368  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2795  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.65 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1505  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.52 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0654454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.93 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3595  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.38 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.78 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3510  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.27 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.79 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.94 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3610  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.89 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>