More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1985 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 359 aa  735    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3671  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.16 
 
 		 356 aa  539  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5898  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.55 
 
 		 358 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115502  normal  0.433986 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.67 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.51 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.43 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.96 
 
 		 373 aa  381  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.79 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.47 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.18 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.69 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.5 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.47 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.59 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.48 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2864  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.93 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.020128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.67 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3744  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.48 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.84 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.66 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.49 
 
 		 358 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.68 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.68 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.89 
 
 		 371 aa  368  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.91 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.04 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.01 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.35 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.1 
 
 		 353 aa  364  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.19 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.19 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.44 
 
 		 373 aa  363  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.96 
 
 		 357 aa  364  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.91 
 
 		 360 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.76 
 
 		 360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.37 
 
 		 360 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.04 
 
 		 360 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.52 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.04 
 
 		 352 aa  360  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.21 
 
 		 358 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.23 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.84 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.08 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.2 
 
 		 357 aa  359  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.47 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.15 
 
 		 355 aa  359  5e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.09 
 
 		 357 aa  358  6e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.52 
 
 		 360 aa  358  6e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.79 
 
 		 363 aa  358  8e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.67 
 
 		 356 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.84 
 
 		 353 aa  358  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3428  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.11 
 
 		 352 aa  357  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0767  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.4 
 
 		 356 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.92 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.22 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.43 
 
 		 363 aa  355  6.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1304  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.73 
 
 		 351 aa  353  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.97 
 
 		 360 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.32 
 
 		 359 aa  353  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 357 aa  353  2e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.98 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.54 
 
 		 379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.46 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.32 
 
 		 357 aa  352  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.82 
 
 		 360 aa  352  5e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.41 
 
 		 359 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.42 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1085  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.08 
 
 		 348 aa  350  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.97 
 
 		 357 aa  348  6e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1793  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.95 
 
 		 356 aa  348  6e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.83 
 
 		 357 aa  348  7e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.83 
 
 		 357 aa  347  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.96 
 
 		 353 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.51 
 
 		 351 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  51 
 
 		 357 aa  347  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1677  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.69 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4494  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.53 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 360 aa  346  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.7 
 
 		 362 aa  346  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.55 
 
 		 357 aa  345  5e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.87 
 
 		 352 aa  345  6e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.65 
 
 		 359 aa  345  7e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.83 
 
 		 362 aa  345  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04390  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.65 
 
 		 375 aa  344  1e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.930022 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.42 
 
 		 359 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.66 
 
 		 363 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2131  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.38 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.609597  normal  0.0221523 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 357 aa  344  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.7 
 
 		 356 aa  343  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.4 
 
 		 354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1852  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.1 
 
 		 355 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614244  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0745  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.76 
 
 		 365 aa  342  4e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000247717  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1726  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.1 
 
 		 355 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0775  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.1 
 
 		 355 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2313  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.1 
 
 		 355 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.941716  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.1 
 
 		 355 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172832  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0523  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.1 
 
 		 355 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.653046  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1643  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.1 
 
 		 355 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.82 
 
 		 356 aa  342  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3847  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.83 
 
 		 355 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.937841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>