More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4439 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
357 aa  708    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.11 
 
 
373 aa  508  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.15 
 
 
367 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0588  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.82 
 
 
358 aa  465  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.66 
 
 
373 aa  452  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.56 
 
 
373 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3336  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.63 
 
 
353 aa  444  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.1 
 
 
371 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.42 
 
 
371 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.08 
 
 
369 aa  419  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.22 
 
 
362 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.87 
 
 
356 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.02 
 
 
357 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.18 
 
 
354 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2070  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.52 
 
 
353 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1807  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.52 
 
 
353 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.833313  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1886  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.96 
 
 
353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.03 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3548  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.89 
 
 
341 aa  401  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.4 
 
 
359 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.65 
 
 
358 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.31 
 
 
356 aa  398  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.14 
 
 
363 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.59 
 
 
360 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.75 
 
 
360 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.59 
 
 
360 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0745  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.88 
 
 
365 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000247717  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.71 
 
 
358 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.03 
 
 
360 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.91 
 
 
360 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.03 
 
 
360 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.71 
 
 
358 aa  385  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.03 
 
 
360 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.27 
 
 
357 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 
360 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.75 
 
 
357 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0283  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.15 
 
 
353 aa  382  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0535154  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.75 
 
 
357 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.19 
 
 
359 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.19 
 
 
360 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.03 
 
 
360 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.06 
 
 
363 aa  378  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.47 
 
 
360 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.9 
 
 
354 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.34 
 
 
357 aa  373  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.77 
 
 
379 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3744  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 
360 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.93 
 
 
355 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.06 
 
 
357 aa  372  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.19 
 
 
357 aa  368  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0826  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.25 
 
 
365 aa  368  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.54 
 
 
360 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0890  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.79 
 
 
370 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.66 
 
 
361 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.91 
 
 
357 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.78 
 
 
362 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0834  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.79 
 
 
370 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.653748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.63 
 
 
357 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4224  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.07 
 
 
370 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.185237 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.59 
 
 
357 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.71 
 
 
359 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.66 
 
 
361 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.41 
 
 
358 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.11 
 
 
350 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.37 
 
 
358 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5898  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.63 
 
 
358 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115502  normal  0.433986 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.37 
 
 
358 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 
370 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.143543  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.35 
 
 
364 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.91 
 
 
357 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.42 
 
 
356 aa  365  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.6 
 
 
362 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3287  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.96 
 
 
371 aa  364  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339501  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3671  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.91 
 
 
356 aa  364  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.63 
 
 
357 aa  363  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1304  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.14 
 
 
351 aa  363  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_730  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.88 
 
 
365 aa  363  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000128158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3178  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 
370 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2147  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.5 
 
 
370 aa  363  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377914  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.97 
 
 
353 aa  362  6e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.62 
 
 
356 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.21 
 
 
352 aa  362  8e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1670  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.16 
 
 
347 aa  362  8e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.82 
 
 
362 aa  362  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1170  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.37 
 
 
345 aa  361  8e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1904  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.78 
 
 
365 aa  361  9e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000997715  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2524  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.72 
 
 
369 aa  361  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2864  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.69 
 
 
372 aa  361  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.020128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.23 
 
 
359 aa  360  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4359  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.91 
 
 
370 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.92 
 
 
361 aa  360  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2747  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.44 
 
 
369 aa  360  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260828  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2452  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.44 
 
 
369 aa  358  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0855456  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.68 
 
 
359 aa  358  7e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.56 
 
 
357 aa  358  7e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 
360 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.59 
 
 
367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1323  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.48 
 
 
354 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3428  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 
352 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.78 
 
 
356 aa  355  5e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>