More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_2252 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 357 aa  723    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.24 
 
 		 358 aa  485  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.66 
 
 		 356 aa  461  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.41 
 
 		 356 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.78 
 
 		 362 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.41 
 
 		 352 aa  430  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.81 
 
 		 371 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.52 
 
 		 355 aa  424  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.64 
 
 		 358 aa  423  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.36 
 
 		 371 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.5 
 
 		 363 aa  419  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.26 
 
 		 357 aa  413  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0597  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.01 
 
 		 523 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000598819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  60 
 
 		 352 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.76 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.26 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.54 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.26 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.26 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.89 
 
 		 357 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.56 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.58 
 
 		 356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.17 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.26 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.66 
 
 		 373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.54 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.06 
 
 		 353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.4 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.83 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0908  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.18 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0378851  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.11 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.84 
 
 		 369 aa  401  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.26 
 
 		 357 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1904  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.26 
 
 		 365 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000997715  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.99 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.97 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3353  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.9 
 
 		 362 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.133211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.26 
 
 		 357 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.66 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.1 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.43 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0045  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.06 
 
 		 362 aa  401  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146911  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.61 
 
 		 357 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.54 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.06 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000206723  normal  0.0345378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1045  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.82 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.18231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.38 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  56 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2879  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.06 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.77 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.93 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.57 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0348  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.21 
 
 		 363 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000128786  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.71 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.92 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.74 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.14 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.77 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.22 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.18 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.93 
 
 		 353 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.26 
 
 		 362 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.98 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.98 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00075  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.87 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3525  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.87 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3584  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.87 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0076  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.87 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0078  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.87 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0080  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.6 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.7 
 
 		 361 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0593  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.71 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.71 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.7 
 
 		 361 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.54 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.83 
 
 		 373 aa  389  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0078  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.87 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.42 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.69 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00074  hypothetical protein  54.87 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3796  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.04 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0621  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.87 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0240916 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29616  predicted protein  55.62 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.26 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.14 
 
 		 362 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0067  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.6 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.83 
 
 		 379 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.15 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.98 
 
 		 373 aa  386  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3819  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.74 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.69 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.9 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2987  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.98 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.372327 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1505  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.86 
 
 		 365 aa  381  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0654454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1793  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.94 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.97 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.06 
 
 		 357 aa  381  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.65 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>