More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1193 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
363 aa  740    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.08 
 
 
371 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.22 
 
 
362 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.34 
 
 
355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.9 
 
 
356 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.06 
 
 
360 aa  435  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.86 
 
 
350 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.91 
 
 
371 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.49 
 
 
357 aa  433  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.05 
 
 
356 aa  430  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.82 
 
 
358 aa  428  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.87 
 
 
359 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.43 
 
 
358 aa  428  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.98 
 
 
358 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.51 
 
 
360 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.67 
 
 
357 aa  424  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.79 
 
 
360 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.06 
 
 
353 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.26 
 
 
351 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.37 
 
 
356 aa  421  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  55 
 
 
357 aa  418  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.39 
 
 
360 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.83 
 
 
360 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.83 
 
 
360 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1920  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.66 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.33 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.56 
 
 
360 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.56 
 
 
360 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.34 
 
 
362 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.33 
 
 
354 aa  412  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.18 
 
 
358 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.98 
 
 
355 aa  412  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.32 
 
 
360 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.56 
 
 
360 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.58 
 
 
352 aa  412  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.33 
 
 
354 aa  412  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.67 
 
 
357 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.11 
 
 
360 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.4 
 
 
360 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.56 
 
 
357 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.5 
 
 
357 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.4 
 
 
373 aa  411  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.83 
 
 
360 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.47 
 
 
364 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.82 
 
 
356 aa  410  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.9 
 
 
361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0908  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.58 
 
 
362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0378851  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.02 
 
 
359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.9 
 
 
361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001657  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.54 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.21 
 
 
358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.21 
 
 
358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.96 
 
 
354 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.95 
 
 
357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.78 
 
 
362 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000206723  normal  0.0345378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.29 
 
 
379 aa  401  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0045  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.15 
 
 
362 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3353  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.74 
 
 
362 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.133211 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00816  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.7 
 
 
363 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.77 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0348  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.15 
 
 
363 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000128786  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.46 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1904  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.49 
 
 
365 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000997715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.9 
 
 
373 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.9 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.77 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.07 
 
 
362 aa  399  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.19 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.89 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2879  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.03 
 
 
362 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2066  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.03 
 
 
363 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3775  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.54 
 
 
358 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1045  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.9 
 
 
362 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.18231  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.8 
 
 
355 aa  397  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0335  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.22 
 
 
364 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3819  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.4 
 
 
364 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0785  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.37 
 
 
369 aa  392  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.537709  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.5 
 
 
357 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4369  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.8 
 
 
355 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1677  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.12 
 
 
367 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2131  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.7 
 
 
355 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.609597  normal  0.0221523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6847  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.52 
 
 
355 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0118477  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.61 
 
 
357 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2887  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.52 
 
 
355 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.423656  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2917  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.37 
 
 
364 aa  391  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.04 
 
 
353 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0391  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.74 
 
 
358 aa  391  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.94 
 
 
361 aa  391  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.87 
 
 
356 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.97 
 
 
359 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.14 
 
 
357 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.89 
 
 
357 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.87 
 
 
356 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.89 
 
 
357 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4235  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.12 
 
 
364 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.26 
 
 
360 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0078  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.89 
 
 
363 aa  388  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1793  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 
356 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0472  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.12 
 
 
364 aa  388  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.74 
 
 
352 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>