More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2917 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2917  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 364 aa  743    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.3 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.37 
 
 		 363 aa  391  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.62 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.98 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.78 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.6 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.29 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.69 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.1 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.33 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.28 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.11 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.41 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.41 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.56 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1846  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.87 
 
 		 350 aa  360  3e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.97 
 
 		 371 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.54 
 
 		 359 aa  360  3e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.99 
 
 		 356 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.52 
 
 		 371 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.86 
 
 		 350 aa  357  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.11 
 
 		 357 aa  358  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.68 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.83 
 
 		 362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.57 
 
 		 351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 352 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.22 
 
 		 357 aa  355  5e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.33 
 
 		 354 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.27 
 
 		 352 aa  355  6.999999999999999e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.85 
 
 		 358 aa  354  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1793  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.39 
 
 		 356 aa  354  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.76 
 
 		 352 aa  354  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0498293 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.86 
 
 		 355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 		 353 aa  353  4e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.83 
 
 		 359 aa  353  4e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.39 
 
 		 373 aa  352  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6847  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.69 
 
 		 355 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0118477  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.27 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1677  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.39 
 
 		 367 aa  351  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.99 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.83 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0850  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 352 aa  350  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.898844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.11 
 
 		 356 aa  349  4e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0348  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.85 
 
 		 363 aa  349  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000128786  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.56 
 
 		 357 aa  349  4e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2070  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.95 
 
 		 353 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1807  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.95 
 
 		 353 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.833313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3587  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.97 
 
 		 364 aa  349  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.84 
 
 		 364 aa  348  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1886  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.65 
 
 		 353 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4235  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.69 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.59 
 
 		 373 aa  348  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17341  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.55 
 
 		 357 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.09 
 
 		 355 aa  347  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.55 
 
 		 373 aa  347  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.12 
 
 		 353 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2887  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.56 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.423656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.14 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3827  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.56 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2864  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.57 
 
 		 372 aa  347  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.020128  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3744  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.84 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0369  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.69 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3819  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.84 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0908  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0378851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0472  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 		 364 aa  346  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3775  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.29 
 
 		 358 aa  346  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0394  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 		 364 aa  347  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3760  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.4 
 
 		 364 aa  346  3e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.930795  normal  0.184493 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.14 
 
 		 360 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.27 
 
 		 362 aa  346  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.42 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0745  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.45 
 
 		 365 aa  345  5e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000247717  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.41 
 
 		 353 aa  345  6e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0194  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.14 
 
 		 359 aa  345  8e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18652  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0045  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.71 
 
 		 362 aa  345  8e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 		 354 aa  344  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.99 
 
 		 356 aa  344  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2131  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.56 
 
 		 355 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.609597  normal  0.0221523 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1643  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.99 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.22 
 
 		 369 aa  344  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0523  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.99 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.653046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.99 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172832  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1726  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.99 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1852  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.99 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614244  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0775  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.99 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.1 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0386  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.84 
 
 		 364 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2313  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.99 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.941716  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0412  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.84 
 
 		 364 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160123 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4627  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.391224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.56 
 
 		 364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2162  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.27 
 
 		 363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0767  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.7 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.29 
 
 		 358 aa  342  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.29 
 
 		 358 aa  342  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.42 
 
 		 359 aa  343  4e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.71 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0603  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.14 
 
 		 353 aa  342  5e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.58 
 
 		 357 aa  342  5e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>