More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1320 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
343 aa  698    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1170  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.94 
 
 
345 aa  482  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1492  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.62 
 
 
354 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1286  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.62 
 
 
354 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1285  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.62 
 
 
354 aa  362  6e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1312  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.62 
 
 
354 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1421  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.62 
 
 
354 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3890  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.18 
 
 
354 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1323  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.89 
 
 
354 aa  360  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1454  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.89 
 
 
354 aa  359  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1521  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.33 
 
 
354 aa  358  7e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1670  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.89 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1560  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.04 
 
 
354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2132  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.31 
 
 
348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2095  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.31 
 
 
348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1124  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.87 
 
 
354 aa  351  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.8369  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.22 
 
 
357 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.65 
 
 
358 aa  345  7e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.69 
 
 
352 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 
371 aa  338  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.23 
 
 
358 aa  338  8e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.23 
 
 
367 aa  338  8e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.92 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3336  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.67 
 
 
353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.98 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.8 
 
 
373 aa  336  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3130  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.85 
 
 
355 aa  334  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.462237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3671  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.48 
 
 
356 aa  334  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2031  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.3 
 
 
357 aa  333  4e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.989217  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 
363 aa  331  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.43 
 
 
371 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.42 
 
 
355 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 
359 aa  330  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.13 
 
 
356 aa  328  7e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3548  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.71 
 
 
341 aa  327  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.86 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.56 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.84 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.01 
 
 
355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.84 
 
 
360 aa  325  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.02 
 
 
352 aa  325  9e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0498293 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.7 
 
 
373 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04310  3-isopropylmalate dehydrogenase, putative  50.69 
 
 
373 aa  324  1e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.99 
 
 
373 aa  324  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.55 
 
 
357 aa  324  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.44 
 
 
355 aa  324  2e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2917  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.15 
 
 
364 aa  323  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 
360 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 
360 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.42 
 
 
354 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2222  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.3 
 
 
362 aa  323  3e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.84 
 
 
360 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5898  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.02 
 
 
358 aa  322  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115502  normal  0.433986 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0745  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.65 
 
 
365 aa  322  7e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000247717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.6 
 
 
362 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.29 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 
358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 
369 aa  320  3e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.18 
 
 
355 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 
360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 
360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 
360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0603  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.85 
 
 
353 aa  318  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 
360 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1846  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 
350 aa  317  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 
360 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0850  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.14 
 
 
352 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.898844  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.55 
 
 
359 aa  315  6e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.48 
 
 
358 aa  315  8e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3428  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.96 
 
 
352 aa  314  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.76 
 
 
357 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1085  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.71 
 
 
348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 
354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 
354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.3 
 
 
356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.83 
 
 
353 aa  312  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.43 
 
 
359 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2070  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 
353 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1807  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 
353 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.833313  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2864  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.85 
 
 
372 aa  310  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.020128  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.06 
 
 
360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1886  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.44 
 
 
353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2662  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.04 
 
 
369 aa  309  4e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.42 
 
 
356 aa  308  6.999999999999999e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3744  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.4 
 
 
360 aa  308  6.999999999999999e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.44 
 
 
352 aa  308  8e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.03 
 
 
357 aa  308  8e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1934  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.95 
 
 
367 aa  308  8e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169189  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.42 
 
 
357 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.63 
 
 
356 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.71 
 
 
353 aa  306  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.45 
 
 
357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.45 
 
 
357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.66 
 
 
359 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.55 
 
 
359 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.99 
 
 
352 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1304  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.56 
 
 
351 aa  305  7e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3819  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.22 
 
 
364 aa  305  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.55 
 
 
360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.68 
 
 
357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>