More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1170 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1170  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 345 aa  694    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.94 
 
 		 343 aa  482  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2132  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.51 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2095  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.51 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2031  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.6 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.989217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1285  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.07 
 
 		 354 aa  381  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1323  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.65 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1521  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.78 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1492  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.78 
 
 		 354 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.16 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1312  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.78 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1286  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.49 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1560  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.49 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1421  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.78 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3890  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.78 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1454  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.78 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1124  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.34 
 
 		 354 aa  371  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.8369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.01 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1670  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.25 
 
 		 347 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.37 
 
 		 357 aa  361  8e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 359 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.13 
 
 		 363 aa  355  5.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.41 
 
 		 354 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.98 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.99 
 
 		 352 aa  353  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.42 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.7 
 
 		 360 aa  352  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.98 
 
 		 360 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.98 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.98 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3336  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.4 
 
 		 353 aa  349  4e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.84 
 
 		 357 aa  348  1e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.57 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.7 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  51 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1807  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.1 
 
 		 353 aa  345  4e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.833313  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.42 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.54 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 359 aa  345  6e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.7 
 
 		 357 aa  345  7e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2070  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.1 
 
 		 353 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3130  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.01 
 
 		 355 aa  345  8.999999999999999e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.462237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.37 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.26 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.39 
 
 		 373 aa  344  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.69 
 
 		 351 aa  343  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3548  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.15 
 
 		 341 aa  343  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1886  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.82 
 
 		 353 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.88 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.42 
 
 		 354 aa  342  4e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 359 aa  342  5e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1846  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.75 
 
 		 350 aa  342  5e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.58 
 
 		 359 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 		 359 aa  342  8e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 		 356 aa  341  9e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0194  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 359 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18652  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.07 
 
 		 357 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.66 
 
 		 373 aa  341  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.86 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.6 
 
 		 358 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 357 aa  339  5e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.44 
 
 		 356 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04310  3-isopropylmalate dehydrogenase, putative  52.34 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3671  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.15 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.37 
 
 		 352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0498293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0283  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.16 
 
 		 353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0535154  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1085  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 348 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.35 
 
 		 358 aa  336  2.9999999999999997e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.6 
 
 		 358 aa  335  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.02 
 
 		 361 aa  335  5.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.99 
 
 		 360 aa  335  9e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.69 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.68 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.69 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.3 
 
 		 355 aa  333  2e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 362 aa  333  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4494  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 346 aa  333  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.58 
 
 		 350 aa  333  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.43 
 
 		 360 aa  332  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.08 
 
 		 357 aa  332  5e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.71 
 
 		 355 aa  332  6e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 		 353 aa  332  6e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.6 
 
 		 357 aa  332  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 357 aa  332  8e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 		 358 aa  332  9e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.29 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.74 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.18 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.15 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.6 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.71 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2472  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0850  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.43 
 
 		 352 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.898844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.71 
 
 		 357 aa  329  4e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.35 
 
 		 362 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1920  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.16 
 
 		 353 aa  329  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>