More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1521 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1521  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
354 aa  726    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1312  3-isopropylmalate dehydrogenase  98.02 
 
 
354 aa  707    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1285  3-isopropylmalate dehydrogenase  97.74 
 
 
354 aa  707    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1286  3-isopropylmalate dehydrogenase  98.02 
 
 
354 aa  710    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1124  3-isopropylmalate dehydrogenase  87.29 
 
 
354 aa  643    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.8369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1421  3-isopropylmalate dehydrogenase  98.02 
 
 
354 aa  707    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1454  3-isopropylmalate dehydrogenase  96.89 
 
 
354 aa  704    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3890  3-isopropylmalate dehydrogenase  96.05 
 
 
354 aa  699    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1560  3-isopropylmalate dehydrogenase  99.72 
 
 
354 aa  724    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1492  3-isopropylmalate dehydrogenase  98.59 
 
 
354 aa  714    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1323  3-isopropylmalate dehydrogenase  95.2 
 
 
354 aa  693    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.14 
 
 
371 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.76 
 
 
371 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1170  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.78 
 
 
345 aa  379  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2132  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.87 
 
 
348 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2095  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.87 
 
 
348 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.79 
 
 
358 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.62 
 
 
362 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.68 
 
 
354 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.13 
 
 
363 aa  364  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.43 
 
 
358 aa  363  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1670  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.43 
 
 
347 aa  360  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.33 
 
 
343 aa  358  7e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.39 
 
 
356 aa  355  5e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.8 
 
 
356 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.87 
 
 
357 aa  353  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.76 
 
 
357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.12 
 
 
352 aa  351  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.63 
 
 
373 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.76 
 
 
357 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.69 
 
 
355 aa  349  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.75 
 
 
359 aa  349  4e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0283  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.42 
 
 
353 aa  348  8e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0535154  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.89 
 
 
363 aa  347  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.59 
 
 
367 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0745  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.68 
 
 
365 aa  344  2e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000247717  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1886  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.69 
 
 
353 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1807  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.98 
 
 
353 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.833313  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2070  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.69 
 
 
353 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.23 
 
 
360 aa  342  7e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.41 
 
 
360 aa  340  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.43 
 
 
373 aa  339  2.9999999999999998e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.8 
 
 
360 aa  339  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.33 
 
 
354 aa  338  7e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.33 
 
 
354 aa  338  7e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.04 
 
 
373 aa  338  9e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0194  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 
359 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18652  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.68 
 
 
360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.9 
 
 
352 aa  335  9e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0498293 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.44 
 
 
359 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.16 
 
 
357 aa  333  2e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.41 
 
 
352 aa  333  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.74 
 
 
355 aa  333  2e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17341  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 
357 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.38 
 
 
360 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.68 
 
 
360 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2917  3-isopropylmalate dehydrogenase  51 
 
 
364 aa  332  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2222  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.34 
 
 
362 aa  332  8e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.38 
 
 
360 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 
353 aa  331  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3548  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.86 
 
 
341 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.79 
 
 
360 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.38 
 
 
360 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.71 
 
 
352 aa  330  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2066  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.16 
 
 
363 aa  330  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0045  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.19 
 
 
362 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.29 
 
 
358 aa  329  4e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001657  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.45 
 
 
363 aa  329  6e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.69 
 
 
356 aa  329  6e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.86 
 
 
358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.02 
 
 
364 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  51 
 
 
357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3336  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.39 
 
 
353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00816  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.19 
 
 
363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1846  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 
350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5898  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.56 
 
 
358 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115502  normal  0.433986 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.58 
 
 
358 aa  326  3e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.74 
 
 
356 aa  327  3e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.02 
 
 
362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.29 
 
 
358 aa  325  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.6 
 
 
361 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.6 
 
 
361 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.29 
 
 
358 aa  325  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2031  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.53 
 
 
357 aa  325  9e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.989217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.79 
 
 
360 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.79 
 
 
360 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.79 
 
 
360 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.15 
 
 
357 aa  323  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3744  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.9 
 
 
360 aa  323  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.75 
 
 
362 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.43 
 
 
359 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3353  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.69 
 
 
362 aa  323  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.133211 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0850  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 
352 aa  323  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.898844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0588  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.74 
 
 
358 aa  322  5e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.4 
 
 
362 aa  322  6e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000206723  normal  0.0345378 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0376  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 
363 aa  322  6e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1865  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.3 
 
 
357 aa  322  7e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436203  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2879  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.69 
 
 
362 aa  322  8e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0908  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.4 
 
 
362 aa  322  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0378851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.51 
 
 
353 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>