More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1670 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1670  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 347 aa  713    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2132  3-isopropylmalate dehydrogenase  74.49 
 
 		 348 aa  536  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2095  3-isopropylmalate dehydrogenase  74.49 
 
 		 348 aa  536  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1454  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.65 
 
 		 354 aa  368  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1492  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.3 
 
 		 354 aa  368  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3890  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.43 
 
 		 354 aa  368  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1170  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.25 
 
 		 345 aa  371  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.81 
 
 		 371 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1312  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.3 
 
 		 354 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1285  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.01 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1286  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.01 
 
 		 354 aa  364  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1323  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.68 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1421  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.3 
 
 		 354 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.16 
 
 		 357 aa  362  7.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.54 
 
 		 371 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1521  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.43 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1124  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.79 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.8369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1560  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.43 
 
 		 354 aa  359  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.89 
 
 		 343 aa  357  1.9999999999999998e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.5 
 
 		 362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.63 
 
 		 373 aa  355  5e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0283  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.58 
 
 		 353 aa  355  5e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0535154  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 360 aa  348  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 360 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.42 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.3 
 
 		 360 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.44 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.73 
 
 		 352 aa  344  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0498293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.21 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.27 
 
 		 373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.58 
 
 		 352 aa  343  4e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0850  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.85 
 
 		 352 aa  343  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.898844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 356 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.9 
 
 		 355 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.27 
 
 		 359 aa  342  7e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.7 
 
 		 360 aa  341  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.9 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2669  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.4 
 
 		 369 aa  341  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.06 
 
 		 363 aa  341  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.88 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.54 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.7 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1846  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.9 
 
 		 350 aa  340  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.7 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.02 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.3 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.3 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2222  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.75 
 
 		 362 aa  339  4e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0745  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.88 
 
 		 365 aa  339  5e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000247717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 362 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.93 
 
 		 352 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.81 
 
 		 357 aa  338  5.9999999999999996e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.21 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2031  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.55 
 
 		 357 aa  338  9.999999999999999e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.989217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.65 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.55 
 
 		 357 aa  336  2.9999999999999997e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3548  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.61 
 
 		 341 aa  336  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.45 
 
 		 354 aa  334  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.09 
 
 		 352 aa  334  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.45 
 
 		 354 aa  334  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.3 
 
 		 357 aa  333  2e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.01 
 
 		 359 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0194  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.01 
 
 		 359 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18652  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.81 
 
 		 357 aa  333  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0603  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.48 
 
 		 353 aa  333  4e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.35 
 
 		 357 aa  333  4e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.48 
 
 		 353 aa  332  4e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2066  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.66 
 
 		 363 aa  332  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.4 
 
 		 362 aa  331  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.79 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.2 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0124  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.51 
 
 		 363 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.736589  normal  0.998111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.51 
 
 		 363 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.2 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0121  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.51 
 
 		 363 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0123  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.51 
 
 		 363 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.51 
 
 		 363 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0349763 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1886  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 353 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.03 
 
 		 373 aa  329  4e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.51 
 
 		 356 aa  329  4e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.91 
 
 		 357 aa  329  4e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.31 
 
 		 364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001657  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.5 
 
 		 363 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.51 
 
 		 357 aa  329  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1807  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 353 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.833313  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3336  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.51 
 
 		 353 aa  328  6e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0621  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.21 
 
 		 363 aa  328  6e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0240916 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2070  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 		 353 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.08 
 
 		 358 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00816  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.04 
 
 		 363 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.92 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.42 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.54 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.92 
 
 		 357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0391  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.94 
 
 		 358 aa  326  4.0000000000000003e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2524  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.69 
 
 		 369 aa  325  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0472  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.07 
 
 		 364 aa  325  6e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>