More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2669 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2669  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 369 aa  737    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2747  3-isopropylmalate dehydrogenase  80.76 
 
 		 369 aa  596  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2524  3-isopropylmalate dehydrogenase  80.76 
 
 		 369 aa  594  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2452  3-isopropylmalate dehydrogenase  81.03 
 
 		 369 aa  596  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0855456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7390  3-isopropylmalate dehydrogenase  78.32 
 
 		 368 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6646  3-isopropylmalate dehydrogenase  77.24 
 
 		 368 aa  551  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2589  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.64 
 
 		 370 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.32 
 
 		 370 aa  491  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300052  normal  0.0119637 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0240  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.76 
 
 		 378 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198337  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3595  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.57 
 
 		 370 aa  488  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1425  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.3 
 
 		 368 aa  480  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2795  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.3 
 
 		 370 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0335  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.94 
 
 		 370 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0490  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.67 
 
 		 370 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3287  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.3 
 
 		 371 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339501  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3510  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.23 
 
 		 370 aa  477  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0226  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.4 
 
 		 370 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0890  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.21 
 
 		 370 aa  473  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4224  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.2 
 
 		 370 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185237 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0834  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.21 
 
 		 370 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.653748  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3178  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.93 
 
 		 370 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.65 
 
 		 370 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.143543  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3381  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.85 
 
 		 370 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461666  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4359  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.82 
 
 		 370 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2147  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.11 
 
 		 370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1191  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.35 
 
 		 370 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.49 
 
 		 366 aa  433  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0440  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.22 
 
 		 373 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1182  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.38 
 
 		 369 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0162  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.95 
 
 		 369 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2518  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.76 
 
 		 369 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3282  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.39 
 
 		 370 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.225159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0081  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.19 
 
 		 368 aa  415  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0813149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0213  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.23 
 
 		 350 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3762  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.7 
 
 		 367 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.3 
 
 		 360 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0859  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.65 
 
 		 351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.2 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.75 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.2 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.14 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.65 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.37 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.37 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.06 
 
 		 356 aa  391  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.32 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.37 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.99 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.92 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.08 
 
 		 362 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.17 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.71 
 
 		 357 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.46 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.97 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.68 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.57 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.76 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.3 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.42 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.1 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.42 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.95 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.95 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.85 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.75 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.89 
 
 		 350 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.59 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1934  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.57 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.44 
 
 		 353 aa  368  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.59 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.1 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.87 
 
 		 356 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.8 
 
 		 363 aa  363  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.61 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.61 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.52 
 
 		 358 aa  362  4e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.33 
 
 		 351 aa  362  6e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.23 
 
 		 364 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0850  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.08 
 
 		 352 aa  362  8e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.898844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2987  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 		 362 aa  360  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.372327 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.42 
 
 		 362 aa  361  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.31 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.24 
 
 		 352 aa  361  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.85 
 
 		 357 aa  360  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.4 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1920  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.94 
 
 		 353 aa  359  5e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1677  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.67 
 
 		 367 aa  358  9e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.72 
 
 		 362 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1571  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.2 
 
 		 367 aa  357  9.999999999999999e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.59 
 
 		 357 aa  357  2.9999999999999997e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 		 353 aa  355  5e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0603  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.51 
 
 		 353 aa  355  5.999999999999999e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.21 
 
 		 357 aa  355  7.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3610  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.51 
 
 		 361 aa  355  8.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.37 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.85 
 
 		 357 aa  353  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1505  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.39 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0654454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.21 
 
 		 357 aa  353  2e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.14 
 
 		 362 aa  353  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>