More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0213 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0213  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 350 aa  701    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2452  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.9 
 
 		 369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0855456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2524  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.62 
 
 		 369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2747  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.62 
 
 		 369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3510  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.22 
 
 		 370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2589  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.33 
 
 		 370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1425  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.94 
 
 		 368 aa  441  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2795  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.78 
 
 		 370 aa  441  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4224  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.13 
 
 		 370 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.41 
 
 		 370 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.143543  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0890  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.5 
 
 		 370 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3178  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.85 
 
 		 370 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0834  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.5 
 
 		 370 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.653748  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3287  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.94 
 
 		 371 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339501  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.33 
 
 		 366 aa  435  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3595  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.5 
 
 		 370 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3381  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.22 
 
 		 370 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.78 
 
 		 370 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300052  normal  0.0119637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7390  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.29 
 
 		 368 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2669  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.23 
 
 		 369 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0240  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.11 
 
 		 378 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198337  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0081  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.71 
 
 		 368 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0813149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6646  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.01 
 
 		 368 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4359  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.17 
 
 		 370 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2518  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.53 
 
 		 369 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3282  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.84 
 
 		 370 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.225159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0440  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.02 
 
 		 373 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0162  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.71 
 
 		 369 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0226  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.72 
 
 		 370 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0335  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.72 
 
 		 370 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0490  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.44 
 
 		 370 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3762  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.22 
 
 		 367 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2147  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.28 
 
 		 370 aa  413  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.32 
 
 		 359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0859  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.53 
 
 		 351 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1191  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.06 
 
 		 370 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1182  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.39 
 
 		 369 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.3 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.31 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.21 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.9 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.49 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.3 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.62 
 
 		 361 aa  381  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.74 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.02 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.93 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.49 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.21 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.93 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.93 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.15 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.39 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.21 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.49 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.62 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.49 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1677  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.81 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.27 
 
 		 362 aa  368  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.69 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.97 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.59 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.65 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.67 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.27 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.65 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.65 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.43 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.96 
 
 		 357 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.96 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1793  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.81 
 
 		 356 aa  362  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.95 
 
 		 356 aa  362  5.0000000000000005e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.08 
 
 		 360 aa  362  6e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.56 
 
 		 350 aa  361  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.29 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2131  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.26 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.609597  normal  0.0221523 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.99 
 
 		 362 aa  360  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.39 
 
 		 364 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.96 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.3 
 
 		 371 aa  358  6e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.95 
 
 		 354 aa  358  7e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.67 
 
 		 356 aa  358  8e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0523  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.653046  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1726  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2313  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.941716  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0775  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341042  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1852  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.75 
 
 		 371 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172832  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0767  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.11 
 
 		 356 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1643  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3847  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.96 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.937841 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4627  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.97 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.391224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.97 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.68 
 
 		 367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3576  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.97 
 
 		 355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4415  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.97 
 
 		 355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.96 
 
 		 356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3343  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.96 
 
 		 355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>