More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2031 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_2031  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
357 aa  734    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.989217  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1170  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.6 
 
 
345 aa  389  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2095  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.45 
 
 
348 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2132  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.45 
 
 
348 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1670  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.55 
 
 
347 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.13 
 
 
363 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.3 
 
 
343 aa  333  4e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1285  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.53 
 
 
354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3890  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.51 
 
 
354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1492  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.53 
 
 
354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1312  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.53 
 
 
354 aa  325  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1421  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.53 
 
 
354 aa  325  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1323  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.38 
 
 
354 aa  325  7e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1454  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.21 
 
 
354 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1521  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.53 
 
 
354 aa  325  9e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.15 
 
 
360 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1286  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.24 
 
 
354 aa  324  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.88 
 
 
357 aa  323  3e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1560  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.24 
 
 
354 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.72 
 
 
360 aa  322  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.88 
 
 
373 aa  322  7e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.57 
 
 
371 aa  322  8e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.57 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.29 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.01 
 
 
356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.29 
 
 
360 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.22 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.59 
 
 
356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.58 
 
 
360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.11 
 
 
358 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.11 
 
 
358 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.29 
 
 
360 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.29 
 
 
360 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.72 
 
 
360 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.71 
 
 
359 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.73 
 
 
355 aa  317  2e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.86 
 
 
360 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.15 
 
 
362 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.69 
 
 
356 aa  315  6e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.74 
 
 
358 aa  315  9e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1846  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.2 
 
 
350 aa  315  9e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.86 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.82 
 
 
352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0498293 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.26 
 
 
355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.22 
 
 
371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.58 
 
 
357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.14 
 
 
369 aa  312  3.9999999999999997e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.56 
 
 
354 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.33 
 
 
359 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.72 
 
 
360 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1124  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.8 
 
 
354 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.8369  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.32 
 
 
356 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.57 
 
 
351 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4403  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.95 
 
 
360 aa  310  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2864  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.42 
 
 
372 aa  309  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.020128  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.91 
 
 
353 aa  309  5e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.05 
 
 
356 aa  308  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0194  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.04 
 
 
359 aa  309  5.9999999999999995e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.69 
 
 
354 aa  308  8e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.69 
 
 
354 aa  308  8e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.3 
 
 
357 aa  308  9e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.7 
 
 
352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.45 
 
 
355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.69 
 
 
352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.82 
 
 
364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.31 
 
 
358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07951  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.34 
 
 
357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.94 
 
 
357 aa  306  3e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.8 
 
 
357 aa  306  3e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1920  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.56 
 
 
353 aa  305  6e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2070  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.14 
 
 
353 aa  305  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3847  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.48 
 
 
355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.937841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4415  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.77 
 
 
355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3576  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.77 
 
 
355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3343  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.48 
 
 
355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3952  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.77 
 
 
355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4627  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.77 
 
 
355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.391224  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1886  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.14 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1807  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.14 
 
 
353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.833313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.71 
 
 
361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.83 
 
 
360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.44 
 
 
359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.3 
 
 
360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0283  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.06 
 
 
353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0535154  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.27 
 
 
358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0603  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.14 
 
 
353 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0674  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.18 
 
 
355 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00238259  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.89 
 
 
355 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17341  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.78 
 
 
357 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1726  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.48 
 
 
355 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.48 
 
 
355 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172832  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0775  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.48 
 
 
355 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341042  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1643  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.48 
 
 
355 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.44 
 
 
357 aa  301  1e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0523  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.48 
 
 
355 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.653046  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2313  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.48 
 
 
355 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.941716  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0850  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.09 
 
 
352 aa  301  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.898844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1852  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.48 
 
 
355 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.2 
 
 
357 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2131  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.88 
 
 
355 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.609597  normal  0.0221523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>