More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0283 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0283  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 353 aa  707    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0535154  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.15 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.01 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.05 
 
 		 362 aa  364  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.87 
 
 		 356 aa  363  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.31 
 
 		 358 aa  362  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 		 355 aa  361  9e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2132  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.59 
 
 		 348 aa  361  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2095  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.59 
 
 		 348 aa  361  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 		 352 aa  360  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.81 
 
 		 362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.87 
 
 		 360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1670  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.58 
 
 		 347 aa  355  5e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.3 
 
 		 360 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.78 
 
 		 362 aa  354  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.24 
 
 		 371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.85 
 
 		 357 aa  352  5e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1323  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.27 
 
 		 354 aa  352  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3130  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.7 
 
 		 355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.462237  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.09 
 
 		 354 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1124  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.42 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.8369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.13 
 
 		 371 aa  349  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.34 
 
 		 356 aa  348  6e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.46 
 
 		 367 aa  348  6e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1521  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.42 
 
 		 354 aa  348  8e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.46 
 
 		 373 aa  348  8e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3890  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.85 
 
 		 354 aa  347  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1492  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.42 
 
 		 354 aa  347  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1312  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.7 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.01 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1454  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.57 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1421  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.7 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.6 
 
 		 360 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1560  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 		 354 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1285  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 		 354 aa  346  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1286  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 		 354 aa  345  8e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 352 aa  345  8e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0498293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3336  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.25 
 
 		 353 aa  345  8.999999999999999e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.73 
 
 		 358 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.03 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.71 
 
 		 360 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.71 
 
 		 360 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.71 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.58 
 
 		 360 aa  342  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 		 364 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.63 
 
 		 356 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.71 
 
 		 357 aa  342  7e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.76 
 
 		 363 aa  341  9e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.88 
 
 		 360 aa  341  9e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.71 
 
 		 357 aa  341  1e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17341  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.42 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0588  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.66 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.78 
 
 		 355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 		 357 aa  339  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.56 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.43 
 
 		 358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.41 
 
 		 357 aa  339  4e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2987  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.51 
 
 		 362 aa  339  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.372327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.81 
 
 		 357 aa  339  5e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3548  3-isopropylmalate dehydrogenase  54 
 
 		 341 aa  338  7e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.16 
 
 		 355 aa  338  8e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001657  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.7 
 
 		 363 aa  338  9e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.84 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.14 
 
 		 358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2917  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.31 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1170  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.16 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.33 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.01 
 
 		 359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.84 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.97 
 
 		 360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3744  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.99 
 
 		 360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00816  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 		 363 aa  334  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.69 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.54 
 
 		 373 aa  333  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2066  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 		 363 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1807  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 353 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.833313  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.93 
 
 		 357 aa  332  5e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.72 
 
 		 357 aa  332  5e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2070  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 353 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1886  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 353 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0194  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.32 
 
 		 359 aa  332  7.000000000000001e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18652  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.24 
 
 		 352 aa  332  7.000000000000001e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.25 
 
 		 359 aa  332  8e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.33 
 
 		 355 aa  332  8e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1846  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.74 
 
 		 350 aa  332  9e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.14 
 
 		 362 aa  331  9e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.04 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.03 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.28 
 
 		 363 aa  330  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.57 
 
 		 373 aa  330  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.82 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04390  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.23 
 
 		 375 aa  330  3e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.930022 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04310  3-isopropylmalate dehydrogenase, putative  49.18 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.66 
 
 		 357 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.59 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4494  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.22 
 
 		 346 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1920  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.01 
 
 		 353 aa  328  6e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.55 
 
 		 352 aa  328  6e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.06 
 
 		 357 aa  328  6e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.14 
 
 		 357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>