More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3130 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3130  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 355 aa  675    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.462237  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.38 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0498293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0283  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.97 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0535154  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.66 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1846  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.26 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.11 
 
 		 371 aa  364  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.79 
 
 		 371 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1170  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.51 
 
 		 345 aa  362  4e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.3 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.85 
 
 		 360 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.68 
 
 		 373 aa  358  8e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.87 
 
 		 356 aa  358  9e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.19 
 
 		 359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.34 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.51 
 
 		 356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.03 
 
 		 343 aa  355  5.999999999999999e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.21 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.21 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.99 
 
 		 360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.55 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17341  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2095  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.83 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2132  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.83 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.25 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.28 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.28 
 
 		 360 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.28 
 
 		 360 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.85 
 
 		 360 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1886  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.99 
 
 		 353 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.85 
 
 		 358 aa  347  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.09 
 
 		 354 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1807  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.7 
 
 		 353 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.833313  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.12 
 
 		 357 aa  346  4e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2070  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.42 
 
 		 353 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.94 
 
 		 362 aa  345  5e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.85 
 
 		 355 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.3 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.29 
 
 		 352 aa  344  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.97 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.49 
 
 		 373 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1085  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.76 
 
 		 348 aa  343  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.79 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  51 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.56 
 
 		 357 aa  343  4e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0593  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.91 
 
 		 363 aa  342  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.13 
 
 		 360 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.51 
 
 		 364 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.99 
 
 		 357 aa  342  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.37 
 
 		 359 aa  342  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0631  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.79 
 
 		 363 aa  342  8e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.27 
 
 		 357 aa  341  1e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.27 
 
 		 357 aa  341  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.56 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.9 
 
 		 359 aa  340  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3336  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.3 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2066  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.75 
 
 		 363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.71 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.82 
 
 		 362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0745  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.48 
 
 		 365 aa  339  4e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000247717  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2864  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.31 
 
 		 372 aa  339  5.9999999999999996e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.020128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00816  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 		 363 aa  339  5.9999999999999996e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3796  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.97 
 
 		 363 aa  338  8e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.98 
 
 		 362 aa  338  9e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.16 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0744  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.69 
 
 		 363 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.51 
 
 		 362 aa  337  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.42 
 
 		 358 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.19 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.42 
 
 		 359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2917  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.41 
 
 		 364 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.93 
 
 		 357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.25 
 
 		 362 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2662  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.65 
 
 		 369 aa  335  5.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3536  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.56 
 
 		 363 aa  335  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2937  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.56 
 
 		 363 aa  335  5.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4494  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.33 
 
 		 346 aa  335  7e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2162  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.96 
 
 		 363 aa  335  7e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.8 
 
 		 361 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.8 
 
 		 361 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001657  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.44 
 
 		 363 aa  335  7.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3775  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.29 
 
 		 358 aa  335  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0194  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.42 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.73 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3671  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.01 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.1 
 
 		 357 aa  333  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.7 
 
 		 359 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.15 
 
 		 357 aa  333  2e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.1 
 
 		 359 aa  334  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.65 
 
 		 357 aa  333  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1492  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.87 
 
 		 354 aa  332  5e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3406  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 363 aa  332  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4235  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.87 
 
 		 364 aa  332  5e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3760  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.87 
 
 		 364 aa  332  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.930795  normal  0.184493 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.85 
 
 		 355 aa  332  6e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3587  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.87 
 
 		 364 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1312  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.87 
 
 		 354 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1421  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.87 
 
 		 354 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0369  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.87 
 
 		 364 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2452  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.04 
 
 		 369 aa  332  8e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0855456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>