More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA04310 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA04310  3-isopropylmalate dehydrogenase, putative  100 
 
 		 373 aa  751    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00912  hypothetical 3-isopropylmalate dehydrogenase (Eurofung)  57.88 
 
 		 366 aa  438  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.233622 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68561  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.89 
 
 		 373 aa  435  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.470494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.25 
 
 		 367 aa  355  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.7 
 
 		 373 aa  352  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.07 
 
 		 357 aa  352  8e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02793  3-isopropylmalate dehydrogenase B (Broad)  49.34 
 
 		 370 aa  349  5e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.67 
 
 		 363 aa  345  5e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.45 
 
 		 357 aa  344  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.65 
 
 		 371 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.37 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.68 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.6 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.34 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1170  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.34 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 		 356 aa  335  7e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 		 355 aa  333  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.07 
 
 		 360 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.25 
 
 		 352 aa  332  9e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2066  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.6 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0391  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.47 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0283  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.18 
 
 		 353 aa  330  3e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0535154  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.14 
 
 		 356 aa  329  4e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.39 
 
 		 356 aa  329  5.0000000000000004e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.19 
 
 		 355 aa  328  7e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.27 
 
 		 373 aa  328  8e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3548  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.59 
 
 		 341 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2095  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.02 
 
 		 348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.66 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2132  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.02 
 
 		 348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.86 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001657  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.07 
 
 		 363 aa  327  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.27 
 
 		 360 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.9 
 
 		 358 aa  327  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.27 
 
 		 360 aa  326  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00816  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.81 
 
 		 363 aa  327  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.27 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.27 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.27 
 
 		 360 aa  326  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.73 
 
 		 356 aa  325  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.57 
 
 		 355 aa  325  7e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.73 
 
 		 360 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.69 
 
 		 343 aa  324  2e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0908  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.46 
 
 		 362 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0378851  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.33 
 
 		 357 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.4 
 
 		 371 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1045  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.07 
 
 		 362 aa  322  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.18231  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0376  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.54 
 
 		 363 aa  322  7e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0745  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.2 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000247717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 360 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2222  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 362 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.87 
 
 		 357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3336  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.51 
 
 		 353 aa  320  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1670  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.89 
 
 		 347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.66 
 
 		 360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0348  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.13 
 
 		 363 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000128786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 		 352 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.06 
 
 		 357 aa  318  7.999999999999999e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.13 
 
 		 359 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2879  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.87 
 
 		 362 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.13 
 
 		 362 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000206723  normal  0.0345378 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.18 
 
 		 355 aa  317  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.68 
 
 		 354 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1846  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.41 
 
 		 350 aa  318  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3353  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.07 
 
 		 362 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.133211 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.27 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1677  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.74 
 
 		 367 aa  316  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 357 aa  317  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 		 357 aa  317  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 362 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.13 
 
 		 357 aa  317  3e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.34 
 
 		 360 aa  316  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.33 
 
 		 354 aa  316  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0744  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.59 
 
 		 363 aa  315  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.13 
 
 		 357 aa  315  9e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.06 
 
 		 358 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0472  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.25 
 
 		 364 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.79 
 
 		 357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0412  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.71 
 
 		 364 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.78 
 
 		 357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0386  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.71 
 
 		 364 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.44 
 
 		 364 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.06 
 
 		 350 aa  312  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1793  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.53 
 
 		 356 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3587  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.25 
 
 		 364 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 356 aa  311  7.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0398  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.71 
 
 		 364 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4209  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.7 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1934  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.44 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3819  3-isopropylmalate dehydrogenase  48 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.73 
 
 		 357 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0045  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.54 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0631  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.86 
 
 		 363 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305099  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3536  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.33 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.56 
 
 		 357 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2937  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.33 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0593  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.33 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0369  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.98 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0336  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.25 
 
 		 364 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.309261  normal  0.513692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>