More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68561 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_68561  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
373 aa  760    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.470494  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00912  hypothetical 3-isopropylmalate dehydrogenase (Eurofung)  61.14 
 
 
366 aa  463  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.233622 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04310  3-isopropylmalate dehydrogenase, putative  58.89 
 
 
373 aa  435  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02793  3-isopropylmalate dehydrogenase B (Broad)  48 
 
 
370 aa  345  6e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.03 
 
 
371 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.68 
 
 
362 aa  331  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.4 
 
 
360 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.87 
 
 
360 aa  328  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.87 
 
 
360 aa  328  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.66 
 
 
356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.21 
 
 
357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.4 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.4 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.5 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.4 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.68 
 
 
371 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.06 
 
 
360 aa  325  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.13 
 
 
360 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.6 
 
 
360 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.94 
 
 
360 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.38 
 
 
373 aa  322  7e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.53 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.25 
 
 
373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.38 
 
 
357 aa  317  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.62 
 
 
357 aa  316  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.81 
 
 
356 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.11 
 
 
358 aa  316  4e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3548  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.31 
 
 
341 aa  314  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1170  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.48 
 
 
345 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.92 
 
 
357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.65 
 
 
357 aa  312  5.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.11 
 
 
379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.57 
 
 
357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.38 
 
 
363 aa  305  6e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.49 
 
 
359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.06 
 
 
362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.42 
 
 
358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.22 
 
 
357 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 
358 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.73 
 
 
373 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.35 
 
 
355 aa  300  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.91 
 
 
369 aa  298  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.65 
 
 
355 aa  298  1e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.86 
 
 
357 aa  298  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1934  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.27 
 
 
367 aa  298  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169189  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.24 
 
 
362 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.03 
 
 
357 aa  296  5e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.84 
 
 
359 aa  296  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.88 
 
 
354 aa  295  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.58 
 
 
357 aa  295  7e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.69 
 
 
355 aa  295  8e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.45 
 
 
359 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1670  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.1 
 
 
347 aa  293  3e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.15 
 
 
362 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3744  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.57 
 
 
360 aa  293  3e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.57 
 
 
355 aa  293  3e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.76 
 
 
360 aa  293  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.68 
 
 
357 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2095  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.38 
 
 
348 aa  292  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2132  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.38 
 
 
348 aa  292  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.44 
 
 
343 aa  292  7e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.04 
 
 
360 aa  292  8e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3762  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.47 
 
 
367 aa  292  8e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0745  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.46 
 
 
365 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000247717  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.58 
 
 
356 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3336  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 
353 aa  291  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.58 
 
 
359 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0588  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.77 
 
 
358 aa  290  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.72 
 
 
357 aa  290  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.4 
 
 
355 aa  290  3e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.75 
 
 
350 aa  290  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3775  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.38 
 
 
358 aa  290  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.51 
 
 
356 aa  290  4e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0440  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.59 
 
 
373 aa  289  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506295  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.01 
 
 
367 aa  288  1e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.72 
 
 
361 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.7 
 
 
352 aa  287  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0081  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.28 
 
 
368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0813149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.38 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.38 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1677  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.28 
 
 
367 aa  286  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0674  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.41 
 
 
355 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00238259  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1793  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.86 
 
 
356 aa  285  7e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3890  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.49 
 
 
354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1920  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.48 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.2 
 
 
362 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3847  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.55 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.937841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2518  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.75 
 
 
369 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3343  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.55 
 
 
355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.85 
 
 
357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1454  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.21 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5898  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.09 
 
 
358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115502  normal  0.433986 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.93 
 
 
358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.29 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.89 
 
 
359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0376  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.22 
 
 
363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0162  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.21 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.21 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1323  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.93 
 
 
354 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.41 
 
 
356 aa  282  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>