More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2222 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2222  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
362 aa  740    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.42 
 
 
352 aa  393  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.32 
 
 
355 aa  388  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 
362 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.55 
 
 
360 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.99 
 
 
363 aa  385  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.02 
 
 
360 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.82 
 
 
371 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.06 
 
 
371 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.52 
 
 
357 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.02 
 
 
360 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.47 
 
 
360 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.2 
 
 
360 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.47 
 
 
360 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.1 
 
 
357 aa  373  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.37 
 
 
360 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.47 
 
 
360 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.41 
 
 
357 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 
358 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.2 
 
 
360 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.2 
 
 
360 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 
357 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.37 
 
 
360 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.55 
 
 
358 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.59 
 
 
356 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.78 
 
 
355 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.64 
 
 
373 aa  364  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.47 
 
 
360 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 
356 aa  363  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.5 
 
 
357 aa  361  1e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.39 
 
 
358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.27 
 
 
357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 
356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.51 
 
 
355 aa  355  7.999999999999999e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.55 
 
 
357 aa  353  2e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1934  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.82 
 
 
367 aa  354  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169189  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.55 
 
 
354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.55 
 
 
354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.67 
 
 
358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.4 
 
 
358 aa  352  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.4 
 
 
358 aa  352  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 
363 aa  352  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.37 
 
 
357 aa  351  1e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0391  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.31 
 
 
358 aa  351  1e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.27 
 
 
357 aa  350  2e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.45 
 
 
360 aa  350  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.64 
 
 
367 aa  350  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0745  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.46 
 
 
365 aa  348  7e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000247717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.82 
 
 
357 aa  347  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.08 
 
 
362 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.83 
 
 
356 aa  347  2e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.37 
 
 
352 aa  346  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.67 
 
 
357 aa  346  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1904  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.93 
 
 
365 aa  346  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000997715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.75 
 
 
359 aa  345  6e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 
369 aa  344  1e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0908  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 
362 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0378851  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.9 
 
 
357 aa  344  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1045  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.17 
 
 
362 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.18231  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0078  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.38 
 
 
363 aa  343  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.11 
 
 
363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0349763 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0121  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.11 
 
 
363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0123  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.11 
 
 
363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0556005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0621  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.66 
 
 
363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0240916 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0080  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.11 
 
 
363 aa  343  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3796  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.49 
 
 
363 aa  343  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.18 
 
 
359 aa  342  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.79 
 
 
354 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.994905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00075  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.38 
 
 
363 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3525  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.38 
 
 
363 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0076  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.38 
 
 
363 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3584  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.38 
 
 
363 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038703 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00074  hypothetical protein  47.38 
 
 
363 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0078  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.38 
 
 
363 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2132  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.59 
 
 
348 aa  342  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.04 
 
 
357 aa  342  8e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0124  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.11 
 
 
363 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.736589  normal  0.998111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.11 
 
 
363 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2095  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.59 
 
 
348 aa  342  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1920  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.56 
 
 
353 aa  341  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3406  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.52 
 
 
363 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1571  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.37 
 
 
367 aa  341  1e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0593  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.37 
 
 
363 aa  341  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2066  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.78 
 
 
363 aa  341  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 
351 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0067  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.11 
 
 
363 aa  340  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0744  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.81 
 
 
363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3353  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.17 
 
 
362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.133211 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.72 
 
 
362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000206723  normal  0.0345378 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2937  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.24 
 
 
363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3536  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.24 
 
 
363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1670  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.75 
 
 
347 aa  339  4e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.82 
 
 
379 aa  339  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.03 
 
 
360 aa  338  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0045  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 
362 aa  338  8e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2879  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.33 
 
 
362 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.29 
 
 
373 aa  337  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 
355 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0194  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.24 
 
 
359 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>