More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1069 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  694    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  51.79 
 
 
335 aa  362  4e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  49.4 
 
 
336 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.49 
 
 
336 aa  330  2e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  48.37 
 
 
330 aa  318  9e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  48.66 
 
 
330 aa  315  5e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  47.77 
 
 
330 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.74 
 
 
325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  46.92 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.86 
 
 
335 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.73 
 
 
325 aa  298  9e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.94 
 
 
325 aa  295  6e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.65 
 
 
325 aa  287  2e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.86 
 
 
326 aa  285  5e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  44.87 
 
 
330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.23 
 
 
334 aa  280  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  43.57 
 
 
335 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.31 
 
 
331 aa  276  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  42.57 
 
 
335 aa  271  9e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  42.98 
 
 
336 aa  271  9e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  42.98 
 
 
336 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  42.98 
 
 
336 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  41.11 
 
 
335 aa  270  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  42.98 
 
 
336 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  41.47 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  43.27 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  42.98 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.32 
 
 
334 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.74 
 
 
333 aa  270  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  43.4 
 
 
335 aa  269  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  43.27 
 
 
335 aa  269  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  42.69 
 
 
335 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  42.98 
 
 
335 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  42.98 
 
 
336 aa  268  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  42.98 
 
 
335 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  42.98 
 
 
335 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  42.98 
 
 
335 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.15 
 
 
348 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  42.98 
 
 
336 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  41.69 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.24 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  41.69 
 
 
335 aa  266  4e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.91 
 
 
332 aa  266  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  44.32 
 
 
339 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  39.47 
 
 
335 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  40.94 
 
 
335 aa  262  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.1 
 
 
339 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.41 
 
 
335 aa  260  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.94 
 
 
336 aa  259  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.84 
 
 
370 aa  258  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  42.57 
 
 
334 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.82 
 
 
339 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.53 
 
 
361 aa  257  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  42.27 
 
 
336 aa  257  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.62 
 
 
360 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.84 
 
 
326 aa  256  3e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.82 
 
 
333 aa  256  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  41.85 
 
 
340 aa  256  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.35 
 
 
331 aa  255  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  38.3 
 
 
348 aa  255  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.18 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.02 
 
 
364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.12 
 
 
331 aa  252  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.28 
 
 
362 aa  251  9.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.33 
 
 
358 aa  251  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  42.27 
 
 
338 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.47 
 
 
334 aa  250  3e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  41.35 
 
 
323 aa  248  8e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.35 
 
 
359 aa  246  3e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  39.05 
 
 
359 aa  245  6e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  38.76 
 
 
359 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.12 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1270  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.9 
 
 
353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  39.22 
 
 
335 aa  242  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.84 
 
 
326 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.55 
 
 
343 aa  239  5e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.98 
 
 
345 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0870  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  41.52 
 
 
332 aa  239  6.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.19 
 
 
361 aa  238  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  39.17 
 
 
377 aa  236  3e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.31 
 
 
342 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2611  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.63 
 
 
360 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0404939  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  40.17 
 
 
360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.36 
 
 
327 aa  236  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  39 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2572  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.63 
 
 
360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2617  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.63 
 
 
360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2804  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.8 
 
 
359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.02 
 
 
357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  39.2 
 
 
480 aa  233  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.82 
 
 
343 aa  231  9e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.67 
 
 
356 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2488  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.57 
 
 
377 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  37.5 
 
 
478 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0172  isocitrate dehydrogenase  38.4 
 
 
471 aa  229  6e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.71 
 
 
356 aa  228  9e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  39 
 
 
321 aa  228  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0791  isocitrate dehydrogenase  37.75 
 
 
472 aa  228  2e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.78 
 
 
357 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.03 
 
 
356 aa  226  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>