More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1172 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  100 
 
 
335 aa  673    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  51.79 
 
 
337 aa  362  4e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.07 
 
 
336 aa  349  3e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  52.98 
 
 
336 aa  346  4e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.18 
 
 
325 aa  333  2e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.01 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.24 
 
 
325 aa  322  7e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.42 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  49.25 
 
 
330 aa  306  3e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  48.66 
 
 
330 aa  305  7e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  48.66 
 
 
330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  46.9 
 
 
331 aa  294  1e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45 
 
 
335 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.29 
 
 
334 aa  282  7.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.35 
 
 
362 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.24 
 
 
330 aa  277  2e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  46.49 
 
 
335 aa  275  8e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  45.61 
 
 
335 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  45.61 
 
 
335 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.57 
 
 
334 aa  272  7e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  43.99 
 
 
336 aa  272  7e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  43.7 
 
 
336 aa  271  9e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  44.28 
 
 
335 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  43.99 
 
 
336 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.98 
 
 
333 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  43.99 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  43.7 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  43.99 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  43.99 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  43.99 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.33 
 
 
334 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  43.99 
 
 
336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.28 
 
 
326 aa  268  8.999999999999999e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.8 
 
 
360 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  43.4 
 
 
335 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  43.7 
 
 
335 aa  267  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  43.4 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  43.4 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  43.4 
 
 
336 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.67 
 
 
332 aa  266  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2488  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.23 
 
 
377 aa  266  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  43.4 
 
 
336 aa  266  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.76 
 
 
360 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  42.57 
 
 
335 aa  260  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.82 
 
 
331 aa  260  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  44.31 
 
 
334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  41.89 
 
 
336 aa  258  8e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  42.61 
 
 
335 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.19 
 
 
338 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  45.03 
 
 
338 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.58 
 
 
326 aa  256  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.47 
 
 
336 aa  256  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.65 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2611  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.74 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0404939  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2572  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.74 
 
 
360 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2617  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.74 
 
 
360 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  41.11 
 
 
335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.61 
 
 
337 aa  252  6e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.11 
 
 
333 aa  251  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.07 
 
 
339 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.5 
 
 
339 aa  249  6e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  42.54 
 
 
360 aa  248  8e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.75 
 
 
327 aa  248  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.81 
 
 
363 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  44.67 
 
 
323 aa  248  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  42.51 
 
 
340 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.67 
 
 
358 aa  247  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.49 
 
 
335 aa  246  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  41.54 
 
 
348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1270  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.11 
 
 
353 aa  246  6e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2885  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.94 
 
 
362 aa  245  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1846  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.6 
 
 
350 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.69 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.58 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.51 
 
 
355 aa  243  3e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1349  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.29 
 
 
356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.07 
 
 
352 aa  242  7e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0498293 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.44 
 
 
357 aa  239  4e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.35 
 
 
331 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  41.06 
 
 
336 aa  239  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.72 
 
 
329 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0329  3-isopropylmalate dehydrogenase oxidoreductase protein  39.71 
 
 
365 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.27 
 
 
331 aa  238  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.52 
 
 
348 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.61 
 
 
361 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  46.04 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1124  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.22 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.8369  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1492  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.37 
 
 
354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.32 
 
 
354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.32 
 
 
354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1285  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.37 
 
 
354 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1286  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.71 
 
 
354 aa  232  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  40.87 
 
 
487 aa  232  6e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.65 
 
 
360 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1560  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.37 
 
 
354 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1521  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.37 
 
 
354 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1312  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.08 
 
 
354 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1421  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.08 
 
 
354 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.37 
 
 
343 aa  231  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.44 
 
 
357 aa  231  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>