More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2762 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 326 aa  643    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  85.32 
 
 		 327 aa  510  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0870  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  74.1 
 
 		 332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  71.78 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.29 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  49.85 
 
 		 330 aa  333  2e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  51.06 
 
 		 330 aa  330  2e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  51.06 
 
 		 330 aa  330  2e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  51.67 
 
 		 330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  50 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.56 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.65 
 
 		 335 aa  279  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.33 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.65 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.2 
 
 		 339 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.58 
 
 		 335 aa  269  5.9999999999999995e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  41.82 
 
 		 335 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.51 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.01 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.09 
 
 		 337 aa  261  8e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  42.12 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.4 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.3 
 
 		 336 aa  258  8e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.52 
 
 		 331 aa  258  9e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  41.82 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.4 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  41.21 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  41.21 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  43.47 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  41.21 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  41.52 
 
 		 335 aa  256  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  40.61 
 
 		 336 aa  256  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.84 
 
 		 337 aa  255  6e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  41.21 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  41.21 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  41.21 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  41.21 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  41.02 
 
 		 336 aa  255  8e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  41.21 
 
 		 336 aa  255  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  40.91 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  40.61 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.83 
 
 		 336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.02 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.24 
 
 		 334 aa  252  8.000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  40.24 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.61 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  41.52 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.56 
 
 		 325 aa  248  7e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  39.58 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.87 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.94 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.76 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.06 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  41.39 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.35 
 
 		 332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.12 
 
 		 336 aa  245  6.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.44 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  41.01 
 
 		 360 aa  241  9e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  39.7 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.98 
 
 		 329 aa  239  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.32 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.54 
 
 		 343 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.46 
 
 		 336 aa  238  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.24 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  40.36 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  38.74 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.34 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  39.4 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  39.4 
 
 		 335 aa  232  5e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.64 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.43 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.52 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  38.25 
 
 		 385 aa  223  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  38.81 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  40 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  40.54 
 
 		 335 aa  221  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  40.69 
 
 		 349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  37.72 
 
 		 367 aa  219  6e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  39.89 
 
 		 352 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91057  isocitrate dehydrogenase  35.84 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.433771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.16 
 
 		 348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  39.19 
 
 		 349 aa  215  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.82 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  39.17 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  39.5 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  41.62 
 
 		 344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  39 
 
 		 370 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  37.13 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1016  tartrate dehydrogenase  38 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02060  isocitrate dehydrogenase (NAD+), putative  35.99 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  38.66 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  38.78 
 
 		 359 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  37.36 
 
 		 361 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  37.36 
 
 		 361 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2113  tartrate dehydrogenase  37.61 
 
 		 368 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00371607 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  37.36 
 
 		 361 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4658  tartrate dehydrogenase  37.71 
 
 		 358 aa  208  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1445  tartrate dehydrogenase  37.54 
 
 		 358 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3593  tartrate dehydrogenase  38.31 
 
 		 360 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>