More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5899 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  100 
 
 		 358 aa  738    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  75.35 
 
 		 354 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  73.37 
 
 		 355 aa  551  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  70.17 
 
 		 358 aa  521  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  65.06 
 
 		 357 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  67.04 
 
 		 363 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  66.01 
 
 		 359 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  66.29 
 
 		 359 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  66.01 
 
 		 359 aa  477  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1028  tartrate dehydrogenase  66.86 
 
 		 377 aa  476  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  65.28 
 
 		 359 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  66.01 
 
 		 359 aa  472  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  63.2 
 
 		 359 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  63.48 
 
 		 359 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  62.29 
 
 		 358 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  66.85 
 
 		 359 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  63.66 
 
 		 359 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  63.66 
 
 		 375 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  62.36 
 
 		 363 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  62.5 
 
 		 361 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  62.5 
 
 		 361 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  62.5 
 
 		 361 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  62.36 
 
 		 373 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  62.85 
 
 		 357 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0534  tartrate dehydrogenase  64.53 
 
 		 358 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457204 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  62.5 
 
 		 361 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  62.5 
 
 		 361 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  62.75 
 
 		 362 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  62.22 
 
 		 361 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  62.75 
 
 		 361 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  61.56 
 
 		 364 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  62.5 
 
 		 361 aa  457  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4115  tartrate dehydrogenase  64.51 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  62.75 
 
 		 361 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  62.22 
 
 		 361 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3166  tartrate dehydrogenase  60.56 
 
 		 361 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  62.29 
 
 		 359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0775  tartrate dehydrogenase  63.03 
 
 		 359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.731125  normal  0.188776 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4999  tartrate dehydrogenase  62.71 
 
 		 357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  60 
 
 		 361 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  60.56 
 
 		 360 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  60 
 
 		 361 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3237  tartrate dehydrogenase  61.28 
 
 		 361 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  60 
 
 		 361 aa  448  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  60.5 
 
 		 360 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3389  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase  63.87 
 
 		 357 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  60.28 
 
 		 363 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  61.08 
 
 		 363 aa  444  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3035  tartrate dehydrogenase  64.15 
 
 		 357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.931781 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5638  tartrate dehydrogenase  61.28 
 
 		 362 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  62.32 
 
 		 362 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0011  tartrate dehydrogenase  61.16 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0015  tartrate dehydrogenase  61.16 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.582572  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1518  tartrate dehydrogenase  61.16 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  61.67 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0014  tartrate dehydrogenase  61.16 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0013  tartrate dehydrogenase  60.88 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0014  tartrate dehydrogenase  61.16 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5538  tartrate dehydrogenase  62.18 
 
 		 367 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1440  tartrate dehydrogenase  61.16 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.918707  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0251  tartrate dehydrogenase  60.33 
 
 		 372 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.66296  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5903  tartrate dehydrogenase  62.18 
 
 		 367 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  58.89 
 
 		 365 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1159  tartrate dehydrogenase  61.16 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  60.22 
 
 		 359 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  58.77 
 
 		 361 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  60.91 
 
 		 352 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  60.72 
 
 		 361 aa  431  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  58.91 
 
 		 352 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  61 
 
 		 361 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  61 
 
 		 361 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  61 
 
 		 361 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  59.1 
 
 		 362 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2191  tartrate dehydrogenase  59.43 
 
 		 363 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3066  tartrate dehydrogenase  59.18 
 
 		 372 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0824079  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  60.17 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  60.17 
 
 		 361 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  58.61 
 
 		 364 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1632  tartrate dehydrogenase  59.67 
 
 		 368 aa  431  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  58.61 
 
 		 364 aa  431  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  59.43 
 
 		 349 aa  425  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2247  tartrate dehydrogenase  58.22 
 
 		 361 aa  421  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141085  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  58.79 
 
 		 350 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  59.06 
 
 		 350 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1788  tartrate dehydrogenase  56.7 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  59.06 
 
 		 350 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2698  tartrate dehydrogenase  56.82 
 
 		 364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0404  tartrate dehydrogenase  60.66 
 
 		 332 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  55.27 
 
 		 349 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.39 
 
 		 351 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0765  tartrate dehydrogenase  52.57 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  52.45 
 
 		 356 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9120  tartrate dehydrogenase  51.56 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6783  tartrate dehydrogenase  50.42 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.45 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1445  tartrate dehydrogenase  49.58 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  52.41 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1120  tartrate dehydrogenase  50 
 
 		 365 aa  361  9e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656227  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1432  tartrate dehydrogenase  50.43 
 
 		 362 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0770  tartrate dehydrogenase  49.44 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>