More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0651 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
326 aa  644    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  72.09 
 
 
326 aa  455  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.29 
 
 
326 aa  417  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0870  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  67.17 
 
 
332 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.5 
 
 
327 aa  395  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  52.05 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  51.74 
 
 
330 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  48.78 
 
 
330 aa  331  9e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  50.79 
 
 
330 aa  328  6e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  49.54 
 
 
331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.07 
 
 
334 aa  302  5.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.15 
 
 
335 aa  299  5e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  45.27 
 
 
339 aa  293  2e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  44.97 
 
 
339 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  44.67 
 
 
339 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.86 
 
 
337 aa  285  5e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  44.18 
 
 
335 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.18 
 
 
335 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  43.88 
 
 
336 aa  280  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  43.88 
 
 
335 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  43.88 
 
 
335 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  43.88 
 
 
335 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  43.88 
 
 
335 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  43.67 
 
 
335 aa  278  7e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  43.58 
 
 
336 aa  278  8e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  43.58 
 
 
336 aa  278  8e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.4 
 
 
321 aa  278  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  43.58 
 
 
336 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  43.88 
 
 
335 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  43.07 
 
 
335 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.41 
 
 
337 aa  276  4e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.07 
 
 
331 aa  276  5e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  43.28 
 
 
336 aa  275  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  42.77 
 
 
336 aa  275  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.18 
 
 
336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  45.21 
 
 
336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  45.43 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.04 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  42.47 
 
 
336 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.84 
 
 
331 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.51 
 
 
338 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.05 
 
 
333 aa  268  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.28 
 
 
335 aa  268  8.999999999999999e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  43.37 
 
 
336 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.32 
 
 
343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  43.58 
 
 
335 aa  265  5.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.6 
 
 
331 aa  265  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  42.99 
 
 
335 aa  265  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.59 
 
 
360 aa  265  8e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.24 
 
 
332 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  42.99 
 
 
335 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  42.17 
 
 
348 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.37 
 
 
334 aa  263  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  42.39 
 
 
340 aa  262  6e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.08 
 
 
325 aa  261  1e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.77 
 
 
336 aa  260  3e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.74 
 
 
333 aa  257  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.29 
 
 
370 aa  256  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  43.54 
 
 
336 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  40.9 
 
 
335 aa  256  4e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  40.9 
 
 
335 aa  255  6e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.56 
 
 
325 aa  252  5.000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  40 
 
 
336 aa  252  5.000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.54 
 
 
362 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.77 
 
 
329 aa  250  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.77 
 
 
348 aa  248  8e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.94 
 
 
361 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  41.19 
 
 
335 aa  246  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  46.85 
 
 
344 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  42.7 
 
 
360 aa  244  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.45 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  40.56 
 
 
364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  42.09 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  39.66 
 
 
377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  39.64 
 
 
336 aa  243  5e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.26 
 
 
322 aa  243  5e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  38.79 
 
 
385 aa  242  6e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.14 
 
 
325 aa  242  7e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  42.09 
 
 
334 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.3 
 
 
325 aa  237  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  42.64 
 
 
335 aa  236  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  39.36 
 
 
367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.87 
 
 
342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.77 
 
 
345 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  40.28 
 
 
370 aa  229  4e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00190  tartrate dehydrogenase, putative  39.15 
 
 
374 aa  229  7e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4369  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.42 
 
 
355 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.71 
 
 
358 aa  226  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.8 
 
 
343 aa  226  6e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.88 
 
 
350 aa  225  8e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.44 
 
 
343 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.61 
 
 
361 aa  225  9e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0770  tartrate dehydrogenase  40.57 
 
 
359 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.144909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1445  tartrate dehydrogenase  40.23 
 
 
358 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2311  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.58 
 
 
355 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2804  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.85 
 
 
359 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2887  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.28 
 
 
355 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.423656  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2131  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.98 
 
 
355 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.609597  normal  0.0221523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2472  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.28 
 
 
355 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4658  tartrate dehydrogenase  39.14 
 
 
358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.77852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>