More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1416 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  100 
 
 		 330 aa  665    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  77.64 
 
 		 330 aa  528  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  78.25 
 
 		 330 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  76.06 
 
 		 331 aa  525  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  76.44 
 
 		 330 aa  520  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.78 
 
 		 326 aa  331  9e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.67 
 
 		 326 aa  319  5e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.85 
 
 		 326 aa  315  5e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0870  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 332 aa  306  3e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.85 
 
 		 334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  47.81 
 
 		 339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  47.52 
 
 		 339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  47.52 
 
 		 339 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  49.12 
 
 		 343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.36 
 
 		 335 aa  301  7.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  47.81 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.54 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  46 
 
 		 362 aa  285  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.87 
 
 		 338 aa  285  9e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  44.87 
 
 		 337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  46.25 
 
 		 335 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  45.24 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.15 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.69 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  43.5 
 
 		 323 aa  269  4e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.74 
 
 		 333 aa  268  8.999999999999999e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.84 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  44.74 
 
 		 340 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  43.49 
 
 		 348 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.07 
 
 		 321 aa  264  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  45.99 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  45.99 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  45.99 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  45.99 
 
 		 336 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  45.72 
 
 		 335 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  42.09 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  44.44 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  45.7 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  45.7 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  45.7 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.55 
 
 		 334 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  45.7 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  45.72 
 
 		 335 aa  258  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  45.4 
 
 		 336 aa  258  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.67 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  45.7 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  44.84 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.9 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  45.1 
 
 		 336 aa  256  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.93 
 
 		 331 aa  255  6e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.94 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.87 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  44.81 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.48 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  43.54 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  44.84 
 
 		 335 aa  252  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.07 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.58 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  43.66 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  44.25 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.28 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.64 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  45.4 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.48 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  42.3 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.24 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.42 
 
 		 361 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  40 
 
 		 370 aa  241  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.43 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.14 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.76 
 
 		 331 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  41.72 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  41.72 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  42.22 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2804  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.38 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  37.98 
 
 		 385 aa  232  6e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.23 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  37.95 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1073  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.29 
 
 		 337 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.606358  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  41.18 
 
 		 335 aa  225  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  36.62 
 
 		 358 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.83 
 
 		 358 aa  224  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.64 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.49 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  38.23 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  36.67 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  41.12 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  40.34 
 
 		 364 aa  223  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  38.2 
 
 		 359 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  39.09 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  38.83 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  37.22 
 
 		 373 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1445  tartrate dehydrogenase  38.24 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  35.56 
 
 		 364 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.72 
 
 		 339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.82 
 
 		 348 aa  219  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  35.13 
 
 		 357 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  35.56 
 
 		 364 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.9 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.83 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>