More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2855 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 339 aa  671    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  74.56 
 
 		 337 aa  497  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.25 
 
 		 336 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.97 
 
 		 347 aa  455  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.55 
 
 		 336 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.55 
 
 		 336 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.55 
 
 		 336 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.15 
 
 		 339 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.41 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.05 
 
 		 348 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.36 
 
 		 336 aa  434  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.57 
 
 		 354 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.39 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.55 
 
 		 340 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.24 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.06 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.06 
 
 		 345 aa  418  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.72 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.01 
 
 		 348 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.54 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.45 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.58 
 
 		 346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  70 
 
 		 342 aa  401  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.35 
 
 		 340 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.09 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.06 
 
 		 350 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.18 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.35 
 
 		 350 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.82 
 
 		 354 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.72 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.61 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.13 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.97 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.22 
 
 		 342 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.64 
 
 		 353 aa  364  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.87 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.85 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.85 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.71 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.86 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.7 
 
 		 353 aa  316  5e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.43 
 
 		 358 aa  311  9e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.85 
 
 		 342 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.7 
 
 		 349 aa  298  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  44.29 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.01 
 
 		 374 aa  290  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.01 
 
 		 371 aa  289  4e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.82 
 
 		 371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  48.35 
 
 		 349 aa  282  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  46.86 
 
 		 350 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5025  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.59 
 
 		 347 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.70387 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.27 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.71 
 
 		 375 aa  279  6e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.12 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  47.15 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  47.15 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00190  tartrate dehydrogenase, putative  45.62 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  44.99 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9120  tartrate dehydrogenase  45.23 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  47.45 
 
 		 370 aa  276  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  46.57 
 
 		 363 aa  275  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.44 
 
 		 347 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00890  tartrate dehydrogenase, putative  45.4 
 
 		 359 aa  275  9e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.88 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4970  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.67 
 
 		 346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.736304  normal  0.0918819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  45.1 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  46.93 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  46.87 
 
 		 352 aa  271  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3035  tartrate dehydrogenase  46.93 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.931781 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  48.28 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  44.79 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  44.79 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  45.99 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5565  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  45.6 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04003  tartrate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04150)  45.51 
 
 		 351 aa  269  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.538835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  45.1 
 
 		 363 aa  269  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  43.68 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3389  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase  46.6 
 
 		 357 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  46.37 
 
 		 359 aa  269  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  45.96 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  44.67 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  45.77 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  45.77 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  45.94 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  45.77 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3034  tartrate dehydrogenase  46.42 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  45.1 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  44.81 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  45.2 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  43.94 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  45.62 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  45.62 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  45.62 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.39 
 
 		 375 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  45.62 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  45.62 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  45.31 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  45.7 
 
 		 358 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  43.44 
 
 		 361 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3388  putative isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase ttuC  46.11 
 
 		 360 aa  265  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>