More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1167 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
354 aa  692    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  87.39 
 
 
339 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  83.48 
 
 
347 aa  558  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  81.45 
 
 
348 aa  555  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  83.19 
 
 
347 aa  547  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  77.62 
 
 
362 aa  465  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.93 
 
 
337 aa  461  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.19 
 
 
358 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.05 
 
 
350 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.12 
 
 
348 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.34 
 
 
350 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.89 
 
 
348 aa  449  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.86 
 
 
339 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.37 
 
 
478 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.03 
 
 
355 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.34 
 
 
354 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.86 
 
 
348 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.01 
 
 
336 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.37 
 
 
336 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.37 
 
 
336 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.37 
 
 
336 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.27 
 
 
353 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.32 
 
 
354 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.54 
 
 
340 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.41 
 
 
358 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.7 
 
 
343 aa  408  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.6 
 
 
336 aa  408  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.99 
 
 
345 aa  408  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.79 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.18 
 
 
342 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.74 
 
 
340 aa  401  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.05 
 
 
346 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.25 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.9 
 
 
343 aa  378  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.03 
 
 
361 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.34 
 
 
342 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.57 
 
 
357 aa  319  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.57 
 
 
357 aa  319  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.85 
 
 
358 aa  318  7.999999999999999e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.01 
 
 
353 aa  317  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.14 
 
 
355 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.56 
 
 
364 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.66 
 
 
349 aa  291  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.94 
 
 
342 aa  290  2e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  43.27 
 
 
357 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.65 
 
 
351 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  46.52 
 
 
358 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  46.25 
 
 
359 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  48.3 
 
 
363 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  50.93 
 
 
349 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  45.06 
 
 
356 aa  275  6e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.97 
 
 
373 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  48 
 
 
359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.21 
 
 
371 aa  273  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  46.11 
 
 
359 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  47.08 
 
 
362 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  46.6 
 
 
363 aa  273  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  46.77 
 
 
363 aa  272  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  49.22 
 
 
352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  47.44 
 
 
359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5440  tartrate dehydrogenase  45.27 
 
 
360 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.18 
 
 
374 aa  270  4e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.11 
 
 
371 aa  269  5.9999999999999995e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  44.38 
 
 
354 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.36 
 
 
375 aa  268  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5024  tartrate dehydrogenase  47.22 
 
 
360 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.56 
 
 
347 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3593  tartrate dehydrogenase  44.7 
 
 
360 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  45.06 
 
 
357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0845  tartrate dehydrogenase  45.6 
 
 
362 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.558114  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3812  tartrate dehydrogenase  44.41 
 
 
360 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.402555  normal  0.309986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1027  tartrate dehydrogenase  43.84 
 
 
354 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1432  tartrate dehydrogenase  45.31 
 
 
362 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  47.08 
 
 
359 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3034  tartrate dehydrogenase  47.74 
 
 
360 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  44.86 
 
 
358 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  44.99 
 
 
352 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  45.85 
 
 
359 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  43.8 
 
 
359 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1620  tartrate dehydrogenase  46.37 
 
 
368 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.607945  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.3 
 
 
374 aa  263  4e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0996  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  45.45 
 
 
361 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.0127706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  45.85 
 
 
375 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  46.24 
 
 
359 aa  262  6e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3389  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase  46.75 
 
 
357 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  45.99 
 
 
361 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.1 
 
 
361 aa  262  8e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04003  tartrate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04150)  45.08 
 
 
351 aa  261  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.538835  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  46.1 
 
 
361 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.1 
 
 
361 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3035  tartrate dehydrogenase  46.43 
 
 
357 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.931781 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.1 
 
 
361 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3388  putative isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase ttuC  47.42 
 
 
360 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  46.1 
 
 
361 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1229  tartrate dehydrogenase  45.62 
 
 
364 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5037  tartrate dehydrogenase  46.23 
 
 
376 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.575355  normal  0.316837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.1 
 
 
361 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4654  tartrate dehydrogenase  44.13 
 
 
360 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  44.48 
 
 
352 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3709  tartrate dehydrogenase  44.13 
 
 
360 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  0.0942262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>