More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13010 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 336 aa  665    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  83.04 
 
 		 336 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  83.04 
 
 		 336 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  83.04 
 
 		 336 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  83.04 
 
 		 336 aa  565  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  83.04 
 
 		 336 aa  544  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  76.51 
 
 		 337 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.41 
 
 		 339 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.51 
 
 		 345 aa  458  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.62 
 
 		 347 aa  454  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.89 
 
 		 342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.34 
 
 		 348 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.83 
 
 		 340 aa  435  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.72 
 
 		 358 aa  428  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.35 
 
 		 362 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  74.11 
 
 		 342 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.09 
 
 		 346 aa  425  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.37 
 
 		 339 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.43 
 
 		 340 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.86 
 
 		 478 aa  421  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.31 
 
 		 348 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.96 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.59 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.74 
 
 		 350 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.99 
 
 		 348 aa  401  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.87 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.19 
 
 		 348 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.67 
 
 		 342 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.58 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  59 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.99 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.66 
 
 		 354 aa  388  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.64 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.5 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.18 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.19 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.31 
 
 		 357 aa  332  6e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.31 
 
 		 357 aa  332  6e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.85 
 
 		 364 aa  328  9e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.27 
 
 		 353 aa  322  7e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.29 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.71 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.86 
 
 		 342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.67 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  44.78 
 
 		 356 aa  281  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.16 
 
 		 351 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  46.67 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  46.25 
 
 		 349 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  45.51 
 
 		 350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  45.51 
 
 		 350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  46.99 
 
 		 349 aa  272  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  46.59 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5025  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.88 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.70387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  45.99 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  45.99 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  46.55 
 
 		 363 aa  269  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  45.1 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.25 
 
 		 347 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.1 
 
 		 371 aa  265  8e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  43.62 
 
 		 358 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4970  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.18 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.736304  normal  0.0918819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  45.04 
 
 		 361 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.59 
 
 		 375 aa  263  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  44.57 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.48 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.34 
 
 		 371 aa  263  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  43.62 
 
 		 359 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.12 
 
 		 374 aa  262  6e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  43.91 
 
 		 361 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04003  tartrate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04150)  44.79 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.538835  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00890  tartrate dehydrogenase, putative  44.38 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  46.42 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  44.89 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  44.34 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  44.51 
 
 		 362 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  45.62 
 
 		 370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  44.48 
 
 		 361 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  43.63 
 
 		 361 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  44.96 
 
 		 359 aa  259  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  44.09 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  46.11 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3166  tartrate dehydrogenase  43.36 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  44.51 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  46.91 
 
 		 359 aa  256  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5601  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.71 
 
 		 347 aa  255  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574649 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  44.24 
 
 		 359 aa  255  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 360 aa  255  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3237  tartrate dehydrogenase  43.62 
 
 		 361 aa  255  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3035  tartrate dehydrogenase  45.45 
 
 		 357 aa  255  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.931781 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.66 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  42.82 
 
 		 360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  43.62 
 
 		 375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  44.19 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3389  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase  45.13 
 
 		 357 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0770  tartrate dehydrogenase  44.65 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144909 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  44.19 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0775  tartrate dehydrogenase  46.3 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.731125  normal  0.188776 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  44.19 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  44.76 
 
 		 362 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  43.66 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>