More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1129 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 343 aa  673    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  93.29 
 
 		 361 aa  606  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.51 
 
 		 346 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.5 
 
 		 348 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.83 
 
 		 347 aa  434  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.61 
 
 		 358 aa  424  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.16 
 
 		 340 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.78 
 
 		 337 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.06 
 
 		 345 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.61 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.51 
 
 		 342 aa  414  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.64 
 
 		 354 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.58 
 
 		 336 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.58 
 
 		 336 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.58 
 
 		 336 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.28 
 
 		 336 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.06 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.2 
 
 		 348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.08 
 
 		 478 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.16 
 
 		 348 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.48 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.39 
 
 		 342 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.18 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.91 
 
 		 339 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.9 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.99 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.13 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.28 
 
 		 336 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.8 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.9 
 
 		 355 aa  386  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.9 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.63 
 
 		 350 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.16 
 
 		 343 aa  371  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.01 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.13 
 
 		 350 aa  363  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.99 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.99 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.71 
 
 		 355 aa  348  8e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.71 
 
 		 358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.83 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.43 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.15 
 
 		 353 aa  326  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.75 
 
 		 342 aa  318  7e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  46.94 
 
 		 356 aa  317  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.84 
 
 		 349 aa  312  6.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  50.89 
 
 		 352 aa  311  9e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  49.71 
 
 		 352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  49.57 
 
 		 363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  46.73 
 
 		 358 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.47 
 
 		 374 aa  291  2e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.38 
 
 		 351 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.47 
 
 		 375 aa  289  6e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3389  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase  46.75 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  44.76 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3035  tartrate dehydrogenase  46.75 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.931781 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  46.2 
 
 		 360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  44.09 
 
 		 359 aa  285  9e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  47.92 
 
 		 349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  47.94 
 
 		 349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.55 
 
 		 371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  50.47 
 
 		 350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  50.47 
 
 		 350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  44.67 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  50.47 
 
 		 350 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  48.35 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.54 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  44.77 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.05 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  44.54 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  44.67 
 
 		 358 aa  279  6e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  46.67 
 
 		 359 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  44.64 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.75 
 
 		 375 aa  276  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.08 
 
 		 374 aa  276  3e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  46.75 
 
 		 362 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  40.76 
 
 		 357 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  43.94 
 
 		 361 aa  275  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1632  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.39 
 
 		 375 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.341727  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  45.6 
 
 		 359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1028  tartrate dehydrogenase  41.6 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4654  tartrate dehydrogenase  45 
 
 		 360 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3709  tartrate dehydrogenase  45 
 
 		 360 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  42.36 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0765  tartrate dehydrogenase  43.77 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  43.54 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  42.94 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  43.49 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3812  tartrate dehydrogenase  43.95 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.402555  normal  0.309986 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  43.54 
 
 		 364 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5024  tartrate dehydrogenase  45.62 
 
 		 360 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  43.82 
 
 		 361 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  43.82 
 
 		 361 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  43.82 
 
 		 361 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  42.65 
 
 		 357 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  42.7 
 
 		 361 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  42.36 
 
 		 359 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  44.78 
 
 		 355 aa  271  9e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3593  tartrate dehydrogenase  43.92 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  45.6 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  43.26 
 
 		 361 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>