More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0981 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 343 aa  699    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.29 
 
 		 348 aa  424  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.45 
 
 		 347 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.54 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.4 
 
 		 350 aa  404  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.13 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.64 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.06 
 
 		 337 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.89 
 
 		 350 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.7 
 
 		 354 aa  396  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.21 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.58 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.61 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.08 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.4 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.4 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.4 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.55 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.55 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.56 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.14 
 
 		 358 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.77 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.59 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  59 
 
 		 336 aa  364  1e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.8 
 
 		 336 aa  364  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.93 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.09 
 
 		 353 aa  360  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.43 
 
 		 345 aa  355  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.94 
 
 		 348 aa  349  4e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.88 
 
 		 361 aa  344  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.25 
 
 		 342 aa  343  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.88 
 
 		 343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.14 
 
 		 358 aa  338  8e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.55 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.06 
 
 		 342 aa  336  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.86 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.83 
 
 		 353 aa  332  6e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.42 
 
 		 340 aa  330  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.99 
 
 		 357 aa  329  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.99 
 
 		 357 aa  329  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.95 
 
 		 342 aa  316  4e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.09 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  45.45 
 
 		 352 aa  299  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.27 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.82 
 
 		 374 aa  292  5e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  46.41 
 
 		 349 aa  291  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1027  tartrate dehydrogenase  44.03 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  46.3 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  46.3 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5024  tartrate dehydrogenase  45.82 
 
 		 360 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5440  tartrate dehydrogenase  43.91 
 
 		 360 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3812  tartrate dehydrogenase  45.51 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.402555  normal  0.309986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  44.83 
 
 		 350 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3593  tartrate dehydrogenase  45.51 
 
 		 360 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  48 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4654  tartrate dehydrogenase  45.2 
 
 		 360 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3709  tartrate dehydrogenase  45.2 
 
 		 360 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  44.44 
 
 		 352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  44.83 
 
 		 357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3186  tartrate dehydrogenase  41.97 
 
 		 362 aa  282  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0996  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  45.2 
 
 		 361 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.0127706 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.35 
 
 		 371 aa  280  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  46.9 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  46.96 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5655  tartrate dehydrogenase  44.41 
 
 		 360 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  46.33 
 
 		 359 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0845  tartrate dehydrogenase  45.34 
 
 		 362 aa  279  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.558114  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  44.69 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  43.77 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  46.31 
 
 		 375 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  46.31 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  45.95 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  44.41 
 
 		 365 aa  276  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  46.33 
 
 		 363 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  42.82 
 
 		 356 aa  276  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  44.13 
 
 		 358 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1229  tartrate dehydrogenase  44.89 
 
 		 364 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  46.04 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  44.1 
 
 		 361 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5037  tartrate dehydrogenase  42.98 
 
 		 376 aa  275  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.575355  normal  0.316837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1445  tartrate dehydrogenase  45.96 
 
 		 358 aa  275  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  46.33 
 
 		 362 aa  275  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.77 
 
 		 375 aa  275  7e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  46.78 
 
 		 359 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0440  tartrate dehydrogenase  42.49 
 
 		 355 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1432  tartrate dehydrogenase  44.27 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  43.92 
 
 		 360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1620  tartrate dehydrogenase  44.1 
 
 		 368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.607945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  44.25 
 
 		 362 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  43.82 
 
 		 361 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  43.82 
 
 		 361 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3176  tartrate dehydrogenase  44.58 
 
 		 358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000641803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  43.98 
 
 		 364 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.86 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  44.17 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.78 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  43.82 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  44.1 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  44.57 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.98 
 
 		 371 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>