More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1472 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 340 aa  673    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  80.88 
 
 		 345 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  77.98 
 
 		 342 aa  498  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  78.64 
 
 		 340 aa  499  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.65 
 
 		 337 aa  490  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.44 
 
 		 336 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.44 
 
 		 336 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.36 
 
 		 336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.44 
 
 		 336 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.67 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.43 
 
 		 358 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.26 
 
 		 348 aa  448  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.26 
 
 		 354 aa  448  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.36 
 
 		 336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.35 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.43 
 
 		 336 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  76.38 
 
 		 342 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.61 
 
 		 348 aa  438  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.18 
 
 		 348 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.26 
 
 		 339 aa  434  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.02 
 
 		 362 aa  430  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.73 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.86 
 
 		 347 aa  424  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.35 
 
 		 478 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.39 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.45 
 
 		 354 aa  421  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.83 
 
 		 350 aa  418  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.83 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.13 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  77.33 
 
 		 342 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  65 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.18 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.28 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.86 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.36 
 
 		 343 aa  371  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.47 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.73 
 
 		 357 aa  328  9e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.73 
 
 		 357 aa  328  9e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.81 
 
 		 342 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.16 
 
 		 353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.29 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.04 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.54 
 
 		 349 aa  292  5e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.48 
 
 		 358 aa  292  5e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  45.77 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.69 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  45.51 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  45.57 
 
 		 352 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  45.11 
 
 		 358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  43.59 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.82 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  45.85 
 
 		 359 aa  261  8.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00890  tartrate dehydrogenase, putative  44.8 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  45.93 
 
 		 350 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  44.38 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  44.83 
 
 		 352 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  43.52 
 
 		 359 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  44.41 
 
 		 359 aa  258  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  42.61 
 
 		 360 aa  258  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  42.98 
 
 		 375 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  47.47 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3035  tartrate dehydrogenase  46.1 
 
 		 357 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.931781 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3389  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase  46.1 
 
 		 357 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  46.42 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  45.93 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  42.12 
 
 		 362 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  44.02 
 
 		 359 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  42.69 
 
 		 361 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  46.44 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  41.64 
 
 		 365 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  42.41 
 
 		 359 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  43.15 
 
 		 359 aa  256  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3034  tartrate dehydrogenase  43.84 
 
 		 360 aa  255  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  44.66 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.28 
 
 		 361 aa  255  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  46.28 
 
 		 361 aa  255  8e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.28 
 
 		 361 aa  255  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.28 
 
 		 361 aa  255  8e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  46.28 
 
 		 361 aa  255  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3388  putative isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase ttuC  43.84 
 
 		 360 aa  255  9e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  46.18 
 
 		 350 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  46.18 
 
 		 350 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  45.78 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  45.95 
 
 		 361 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  46.28 
 
 		 361 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  46.28 
 
 		 361 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  42.78 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5025  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.62 
 
 		 347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.70387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  42.78 
 
 		 362 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  42.36 
 
 		 359 aa  252  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1432  tartrate dehydrogenase  42.77 
 
 		 362 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2191  tartrate dehydrogenase  41.26 
 
 		 363 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5538  tartrate dehydrogenase  45.34 
 
 		 367 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  42.33 
 
 		 364 aa  252  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5903  tartrate dehydrogenase  45.34 
 
 		 367 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.94 
 
 		 347 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4970  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.33 
 
 		 346 aa  252  8.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.736304  normal  0.0918819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  42.94 
 
 		 358 aa  252  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  42.33 
 
 		 364 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  45.19 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>