More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1962 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 353 aa  723    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  81.66 
 
 		 364 aa  592  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  75.64 
 
 		 357 aa  557  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  75.64 
 
 		 357 aa  557  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.35 
 
 		 355 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.06 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.47 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.7 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.35 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.46 
 
 		 375 aa  359  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.13 
 
 		 374 aa  358  8e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.65 
 
 		 354 aa  358  9e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.49 
 
 		 349 aa  358  9.999999999999999e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.47 
 
 		 373 aa  352  7e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.83 
 
 		 343 aa  349  5e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.27 
 
 		 375 aa  347  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.46 
 
 		 348 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1632  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.58 
 
 		 375 aa  342  5e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.341727  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.6 
 
 		 348 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.01 
 
 		 371 aa  342  8e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.45 
 
 		 353 aa  341  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.7 
 
 		 346 aa  341  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.07 
 
 		 354 aa  339  4e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.05 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.88 
 
 		 337 aa  332  4e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.7 
 
 		 339 aa  332  7.000000000000001e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.75 
 
 		 347 aa  327  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.15 
 
 		 358 aa  327  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.57 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.57 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.57 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.85 
 
 		 336 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.89 
 
 		 348 aa  322  6e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.73 
 
 		 362 aa  322  7e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.99 
 
 		 478 aa  322  7e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.44 
 
 		 361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.43 
 
 		 354 aa  320  3e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.57 
 
 		 355 aa  319  5e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.75 
 
 		 339 aa  318  7.999999999999999e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  47.18 
 
 		 356 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.42 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.51 
 
 		 342 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 		 350 aa  312  4.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.56 
 
 		 336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.09 
 
 		 340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.58 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.02 
 
 		 350 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.89 
 
 		 345 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.7 
 
 		 342 aa  300  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.38 
 
 		 342 aa  293  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  46.3 
 
 		 358 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.07 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  43.91 
 
 		 352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 		 342 aa  285  7e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.45 
 
 		 351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  46.48 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  44.13 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  44.13 
 
 		 361 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  44.13 
 
 		 361 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  44.13 
 
 		 361 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  45.48 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  44.13 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  44.13 
 
 		 361 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  44.13 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  44.13 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  44.13 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.95 
 
 		 347 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5025  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.28 
 
 		 347 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.70387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  43.56 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  46.18 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  44.13 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  43.12 
 
 		 357 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0765  tartrate dehydrogenase  46.61 
 
 		 364 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3166  tartrate dehydrogenase  43.9 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  44.75 
 
 		 358 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  43.73 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  41.08 
 
 		 358 aa  272  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  41.69 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  42.29 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  44.51 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  43.29 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  43.71 
 
 		 349 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3237  tartrate dehydrogenase  44.21 
 
 		 361 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1612  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.91 
 
 		 370 aa  269  5e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  41.93 
 
 		 357 aa  268  8e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  44.04 
 
 		 359 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.16 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3388  putative isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase ttuC  41.97 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9120  tartrate dehydrogenase  41.79 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  43.9 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3034  tartrate dehydrogenase  41.97 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0182  tartrate dehydrogenase  40.97 
 
 		 357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233133  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1797  tartrate dehydrogenase  40.45 
 
 		 360 aa  265  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0306189  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0770  tartrate dehydrogenase  40.91 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  44.34 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  44.38 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5565  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  40.69 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4999  tartrate dehydrogenase  44.41 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  42.03 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  42.27 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>