More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2077 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  751    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  79.19 
 
 		 373 aa  596  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  75.74 
 
 		 374 aa  585  1e-166  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  75.34 
 
 		 371 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  75.07 
 
 		 375 aa  560  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.19 
 
 		 374 aa  529  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.58 
 
 		 375 aa  511  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1632  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.39 
 
 		 375 aa  509  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.341727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.01 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.91 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.19 
 
 		 357 aa  346  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.19 
 
 		 357 aa  346  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.06 
 
 		 353 aa  335  7.999999999999999e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.98 
 
 		 349 aa  334  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.51 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.39 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  45.04 
 
 		 356 aa  308  8e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  43.48 
 
 		 357 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.59 
 
 		 348 aa  299  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  43.35 
 
 		 357 aa  295  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  43.85 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1612  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.16 
 
 		 370 aa  293  4e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.9 
 
 		 339 aa  292  5e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  43.16 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  43.85 
 
 		 359 aa  288  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  42.74 
 
 		 358 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  44.12 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  43.43 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  40.6 
 
 		 352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3237  tartrate dehydrogenase  42.59 
 
 		 361 aa  286  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  43.16 
 
 		 361 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.81 
 
 		 355 aa  286  5e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  42.63 
 
 		 359 aa  285  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  42.36 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  40.81 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  45.04 
 
 		 352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.67 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  42.13 
 
 		 363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  42.63 
 
 		 375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.78 
 
 		 337 aa  282  6.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  41.69 
 
 		 373 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.25 
 
 		 347 aa  281  9e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  43.58 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3166  tartrate dehydrogenase  42.33 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.85 
 
 		 354 aa  280  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  42.36 
 
 		 362 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  41.82 
 
 		 361 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  41.82 
 
 		 361 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  41.82 
 
 		 361 aa  279  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  42.22 
 
 		 363 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.98 
 
 		 343 aa  279  6e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4999  tartrate dehydrogenase  42.4 
 
 		 357 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  42.09 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4115  tartrate dehydrogenase  42.93 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  43.32 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.33 
 
 		 361 aa  276  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  41.07 
 
 		 358 aa  276  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.02 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.06 
 
 		 361 aa  276  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.06 
 
 		 361 aa  276  6e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1028  tartrate dehydrogenase  42.13 
 
 		 377 aa  275  7e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  42.06 
 
 		 361 aa  275  9e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.06 
 
 		 361 aa  275  9e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.06 
 
 		 361 aa  275  9e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  42.06 
 
 		 361 aa  275  9e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  42.06 
 
 		 361 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  42.06 
 
 		 361 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  41.98 
 
 		 359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  40.48 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.77 
 
 		 347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  41.16 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.92 
 
 		 351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  41.16 
 
 		 365 aa  272  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0182  tartrate dehydrogenase  40.11 
 
 		 357 aa  272  7e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233133  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  44.39 
 
 		 359 aa  271  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0775  tartrate dehydrogenase  44 
 
 		 359 aa  272  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.731125  normal  0.188776 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.96 
 
 		 348 aa  271  9e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.93 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  42.51 
 
 		 361 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  40.7 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  41.64 
 
 		 361 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  41.55 
 
 		 359 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  41.32 
 
 		 364 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  41.32 
 
 		 364 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9120  tartrate dehydrogenase  40.97 
 
 		 362 aa  269  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5638  tartrate dehydrogenase  41.11 
 
 		 362 aa  269  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  40.48 
 
 		 361 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  40.48 
 
 		 361 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  41.73 
 
 		 362 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  40.48 
 
 		 361 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  41.98 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  41.78 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  41.78 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.55 
 
 		 343 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  41.67 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.66 
 
 		 361 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2191  tartrate dehydrogenase  40.97 
 
 		 363 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  40.86 
 
 		 349 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0534  tartrate dehydrogenase  43.58 
 
 		 358 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457204 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  41.06 
 
 		 355 aa  265  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>