More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1947 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 373 aa  747    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  76.49 
 
 		 371 aa  589  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  79.19 
 
 		 371 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.95 
 
 		 374 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.62 
 
 		 375 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.24 
 
 		 374 aa  523  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1632  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.32 
 
 		 375 aa  520  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.341727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.15 
 
 		 375 aa  511  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.67 
 
 		 355 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.67 
 
 		 357 aa  349  5e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.67 
 
 		 357 aa  349  5e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.58 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.49 
 
 		 358 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.47 
 
 		 353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.68 
 
 		 349 aa  329  5.0000000000000004e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  44.24 
 
 		 356 aa  295  6e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  42.67 
 
 		 357 aa  289  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  42.67 
 
 		 357 aa  288  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  41.58 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.24 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.6 
 
 		 348 aa  282  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.76 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  42.13 
 
 		 354 aa  278  9e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  41.38 
 
 		 358 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  41.33 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.23 
 
 		 355 aa  276  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  40.65 
 
 		 363 aa  275  8e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.88 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  42.7 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3166  tartrate dehydrogenase  42.13 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1612  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.48 
 
 		 370 aa  273  3e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.29 
 
 		 337 aa  272  8.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  41.18 
 
 		 359 aa  272  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  39.63 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  42.25 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.01 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.32 
 
 		 347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  42.43 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  39.63 
 
 		 375 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  41.58 
 
 		 358 aa  270  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  39.63 
 
 		 361 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  41.02 
 
 		 363 aa  269  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  40.86 
 
 		 359 aa  268  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  41.11 
 
 		 361 aa  268  8.999999999999999e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  40.85 
 
 		 361 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  39.9 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  40.85 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.17 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  40.85 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  43.58 
 
 		 352 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.16 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  40.85 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  40.85 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3237  tartrate dehydrogenase  40 
 
 		 361 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  41.29 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  40.85 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  39.52 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  40.85 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  40.11 
 
 		 362 aa  265  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  40.85 
 
 		 361 aa  265  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.32 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4999  tartrate dehydrogenase  40.48 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.41 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1028  tartrate dehydrogenase  39.1 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.05 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 361 aa  262  8e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.86 
 
 		 343 aa  262  8e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 361 aa  262  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 361 aa  262  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.05 
 
 		 343 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.51 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  39.78 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.62 
 
 		 354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  39.56 
 
 		 355 aa  258  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.55 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  38.99 
 
 		 364 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0442  tartrate dehydrogenase  40.98 
 
 		 365 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4630  tartrate dehydrogenase  40.44 
 
 		 357 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4115  tartrate dehydrogenase  40.27 
 
 		 387 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  40.22 
 
 		 350 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  40.22 
 
 		 350 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9120  tartrate dehydrogenase  40 
 
 		 362 aa  255  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  39.52 
 
 		 362 aa  255  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  41.02 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  40.16 
 
 		 360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  40.38 
 
 		 349 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5538  tartrate dehydrogenase  39.63 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5903  tartrate dehydrogenase  39.63 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0534  tartrate dehydrogenase  40.69 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457204 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0182  tartrate dehydrogenase  40.11 
 
 		 357 aa  253  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233133  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  39.89 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  39.73 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  39.89 
 
 		 362 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  42.59 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0775  tartrate dehydrogenase  41.69 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.731125  normal  0.188776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5565  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  40.82 
 
 		 357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  39.42 
 
 		 364 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  39.15 
 
 		 364 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  38.1 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.51 
 
 		 478 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>