More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4289 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 346 aa  693    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.05 
 
 		 361 aa  485  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.51 
 
 		 343 aa  481  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.59 
 
 		 348 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.71 
 
 		 347 aa  415  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.77 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.28 
 
 		 348 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.35 
 
 		 337 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.77 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.77 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.41 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.25 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.58 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.71 
 
 		 478 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.95 
 
 		 336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.58 
 
 		 339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.57 
 
 		 362 aa  394  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.87 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.09 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.5 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.31 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.48 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.64 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.1 
 
 		 348 aa  393  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.83 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.46 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.6 
 
 		 353 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.71 
 
 		 339 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.39 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.05 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.56 
 
 		 343 aa  376  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.63 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.21 
 
 		 342 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.17 
 
 		 350 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.08 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.57 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.57 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.97 
 
 		 355 aa  350  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.5 
 
 		 358 aa  341  9e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.57 
 
 		 358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.93 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.45 
 
 		 349 aa  328  8e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.7 
 
 		 353 aa  325  6e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.39 
 
 		 342 aa  318  7e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  48.99 
 
 		 356 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  49.38 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  49.54 
 
 		 359 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.79 
 
 		 375 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.48 
 
 		 371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  48.93 
 
 		 359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.01 
 
 		 371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  48.62 
 
 		 363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.58 
 
 		 351 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.21 
 
 		 374 aa  300  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  46.39 
 
 		 360 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  47.44 
 
 		 358 aa  298  8e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  47.19 
 
 		 360 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  47.88 
 
 		 354 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  48.01 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  47.32 
 
 		 361 aa  295  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  46.76 
 
 		 362 aa  295  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  48.13 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.7 
 
 		 375 aa  294  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3389  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase  49.51 
 
 		 357 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  48.32 
 
 		 359 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  46.59 
 
 		 359 aa  293  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  47.75 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  48.27 
 
 		 352 aa  293  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  46.91 
 
 		 364 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.24 
 
 		 374 aa  292  5e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  47.46 
 
 		 359 aa  292  6e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  47.42 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  45.87 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  45.87 
 
 		 359 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3035  tartrate dehydrogenase  48.7 
 
 		 357 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.931781 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0534  tartrate dehydrogenase  45.82 
 
 		 358 aa  289  6e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457204 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5638  tartrate dehydrogenase  46.76 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  46.05 
 
 		 361 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  50.15 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  45.56 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  45.35 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  45.92 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  46.88 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  45.92 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.24 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  45.92 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  46.34 
 
 		 363 aa  286  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0775  tartrate dehydrogenase  46.09 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.731125  normal  0.188776 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0765  tartrate dehydrogenase  46.7 
 
 		 364 aa  285  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  44.54 
 
 		 365 aa  285  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  45.63 
 
 		 361 aa  285  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  45.35 
 
 		 357 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  47.62 
 
 		 352 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  43.89 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  48.86 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  45.57 
 
 		 375 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  45.57 
 
 		 362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  44.29 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  45.07 
 
 		 361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  43.45 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>