More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3031 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 357 aa  727    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 357 aa  727    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  74.86 
 
 		 364 aa  545  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  75.64 
 
 		 353 aa  541  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.58 
 
 		 355 aa  521  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.4 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.81 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.69 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.37 
 
 		 348 aa  359  5e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.96 
 
 		 354 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.47 
 
 		 374 aa  355  5e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.57 
 
 		 346 aa  354  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.39 
 
 		 354 aa  352  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.91 
 
 		 349 aa  352  7e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.54 
 
 		 371 aa  351  8.999999999999999e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.06 
 
 		 374 aa  350  1e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.27 
 
 		 375 aa  349  3e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.67 
 
 		 373 aa  349  4e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.5 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.08 
 
 		 358 aa  342  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.13 
 
 		 375 aa  339  4e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 		 371 aa  338  5.9999999999999996e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1632  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.4 
 
 		 375 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.341727  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.85 
 
 		 339 aa  337  2.9999999999999997e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.65 
 
 		 478 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.28 
 
 		 361 aa  334  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.27 
 
 		 343 aa  334  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.75 
 
 		 336 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.85 
 
 		 348 aa  331  9e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.13 
 
 		 347 aa  331  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.99 
 
 		 343 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.86 
 
 		 337 aa  328  6e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.74 
 
 		 336 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.74 
 
 		 336 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.74 
 
 		 336 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.1 
 
 		 342 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.71 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.46 
 
 		 336 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.29 
 
 		 339 aa  319  5e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.95 
 
 		 347 aa  318  9e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.11 
 
 		 345 aa  316  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.34 
 
 		 342 aa  316  4e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 		 350 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.42 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.57 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.29 
 
 		 350 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.59 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.31 
 
 		 336 aa  306  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  47.59 
 
 		 356 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.86 
 
 		 342 aa  296  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.58 
 
 		 340 aa  292  8e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  43.87 
 
 		 352 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  43.45 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.57 
 
 		 351 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  45.32 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  43.25 
 
 		 363 aa  281  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  42.25 
 
 		 359 aa  278  8e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  43.65 
 
 		 360 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  45.02 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  42.21 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  42.42 
 
 		 359 aa  275  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  42.54 
 
 		 360 aa  275  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  43.21 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  44.71 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.81 
 
 		 347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5025  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.84 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.70387 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0765  tartrate dehydrogenase  45.22 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  42.53 
 
 		 363 aa  272  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  43.49 
 
 		 361 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  44.51 
 
 		 359 aa  271  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  43.72 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  44.63 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  43.37 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  43.21 
 
 		 361 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  43.37 
 
 		 361 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  43.21 
 
 		 361 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  43.73 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5601  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.35 
 
 		 347 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574649 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  42.22 
 
 		 359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  43.45 
 
 		 361 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  43.45 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  43.45 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  43.45 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  42.78 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  43.45 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  42.21 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  43.45 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  43.45 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  42.42 
 
 		 359 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00190  tartrate dehydrogenase, putative  43.91 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  42.21 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  43.45 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  43.45 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3166  tartrate dehydrogenase  43.24 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  42.53 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  42.21 
 
 		 357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  43.1 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3034  tartrate dehydrogenase  44.19 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0013  tartrate dehydrogenase  41.71 
 
 		 361 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>