More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0187 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 375 aa  756    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.24 
 
 		 371 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  75.07 
 
 		 371 aa  561  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.5 
 
 		 374 aa  559  1e-158  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.62 
 
 		 373 aa  554  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.71 
 
 		 374 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.54 
 
 		 375 aa  535  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1632  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.03 
 
 		 375 aa  523  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.341727  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.13 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.13 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.98 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.27 
 
 		 355 aa  347  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 		 353 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.65 
 
 		 358 aa  337  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.92 
 
 		 349 aa  330  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.83 
 
 		 346 aa  312  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.85 
 
 		 347 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  42.16 
 
 		 352 aa  294  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.38 
 
 		 348 aa  292  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  42.93 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.51 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.18 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.59 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  41.18 
 
 		 356 aa  285  8e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.74 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.69 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  41.6 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.65 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  40.59 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  40.91 
 
 		 358 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  41.8 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  43.21 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.36 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  41.8 
 
 		 361 aa  280  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  41.53 
 
 		 361 aa  279  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  41.33 
 
 		 359 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  41.07 
 
 		 361 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.64 
 
 		 361 aa  278  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  41.53 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  41.53 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  41.53 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  41.53 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  41.53 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  42.66 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  41.33 
 
 		 358 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  41.53 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  42.2 
 
 		 363 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1612  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.7 
 
 		 370 aa  275  6e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3166  tartrate dehydrogenase  40.69 
 
 		 361 aa  275  8e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  42.2 
 
 		 359 aa  275  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4999  tartrate dehydrogenase  40.69 
 
 		 357 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  40.37 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  40.8 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.51 
 
 		 343 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0534  tartrate dehydrogenase  43.09 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0775  tartrate dehydrogenase  43.24 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.731125  normal  0.188776 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.26 
 
 		 347 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.09 
 
 		 348 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.27 
 
 		 348 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  39.73 
 
 		 355 aa  270  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  38.42 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  41.4 
 
 		 359 aa  268  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  41.55 
 
 		 352 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  39.68 
 
 		 363 aa  268  8.999999999999999e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  39.9 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  39.68 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.51 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3237  tartrate dehydrogenase  40.37 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.11 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.09 
 
 		 478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3389  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase  42.7 
 
 		 357 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1028  tartrate dehydrogenase  39.79 
 
 		 377 aa  266  5.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  41.94 
 
 		 359 aa  265  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  39.26 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  39.13 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5538  tartrate dehydrogenase  41.21 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.94 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.94 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5903  tartrate dehydrogenase  41.21 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.94 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4115  tartrate dehydrogenase  40.32 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.46 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3035  tartrate dehydrogenase  42.16 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.931781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  42.78 
 
 		 352 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.66 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.27 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  43.21 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  39.14 
 
 		 350 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  39.15 
 
 		 361 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  39.73 
 
 		 349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  39.14 
 
 		 350 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  39.14 
 
 		 350 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0404  tartrate dehydrogenase  42.21 
 
 		 332 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  39.15 
 
 		 361 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2698  tartrate dehydrogenase  39.47 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0770  tartrate dehydrogenase  38.1 
 
 		 359 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144909 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5638  tartrate dehydrogenase  40.63 
 
 		 362 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>