More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4976 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0014  tartrate dehydrogenase  85.87 
 
 		 396 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0014  tartrate dehydrogenase  85.87 
 
 		 396 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0011  tartrate dehydrogenase  85.87 
 
 		 361 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1518  tartrate dehydrogenase  86.15 
 
 		 361 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  94.18 
 
 		 361 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0013  tartrate dehydrogenase  85.6 
 
 		 361 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0015  tartrate dehydrogenase  85.6 
 
 		 361 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.582572  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  93.91 
 
 		 361 aa  701    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  94.18 
 
 		 361 aa  702    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  94.18 
 
 		 361 aa  703    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1440  tartrate dehydrogenase  85.87 
 
 		 396 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.918707  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  100 
 
 		 361 aa  737    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  93.91 
 
 		 361 aa  701    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  98.34 
 
 		 361 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1159  tartrate dehydrogenase  85.87 
 
 		 396 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  84.03 
 
 		 359 aa  630  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  80.73 
 
 		 360 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  80.73 
 
 		 360 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  81.95 
 
 		 362 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  78.12 
 
 		 361 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  75.98 
 
 		 364 aa  578  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  75.42 
 
 		 364 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  74.58 
 
 		 362 aa  572  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5638  tartrate dehydrogenase  76.19 
 
 		 362 aa  569  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  74.86 
 
 		 365 aa  570  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  78.03 
 
 		 359 aa  566  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2191  tartrate dehydrogenase  74.79 
 
 		 363 aa  557  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  73.67 
 
 		 359 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4115  tartrate dehydrogenase  73.82 
 
 		 387 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  72.27 
 
 		 361 aa  544  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  72.27 
 
 		 361 aa  544  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  72.27 
 
 		 361 aa  544  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  72.27 
 
 		 361 aa  544  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  72.27 
 
 		 361 aa  544  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  72.27 
 
 		 361 aa  545  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  71.99 
 
 		 361 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  71.99 
 
 		 361 aa  541  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  71.99 
 
 		 361 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0251  tartrate dehydrogenase  72.21 
 
 		 372 aa  537  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.66296  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  70.03 
 
 		 359 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  71.31 
 
 		 363 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  71.39 
 
 		 364 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  70.91 
 
 		 373 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  70.82 
 
 		 361 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  70.82 
 
 		 361 aa  530  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  70.82 
 
 		 361 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3166  tartrate dehydrogenase  67.86 
 
 		 361 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  67.04 
 
 		 358 aa  502  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  67.59 
 
 		 361 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3237  tartrate dehydrogenase  67.58 
 
 		 361 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  66.76 
 
 		 362 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  68.84 
 
 		 375 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  67.22 
 
 		 359 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  68.82 
 
 		 359 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3066  tartrate dehydrogenase  67.22 
 
 		 372 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0824079  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0534  tartrate dehydrogenase  70.11 
 
 		 358 aa  491  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  67.32 
 
 		 359 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  66.57 
 
 		 357 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  67.61 
 
 		 359 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1632  tartrate dehydrogenase  67.69 
 
 		 368 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2698  tartrate dehydrogenase  67.13 
 
 		 364 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3389  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase  65.17 
 
 		 357 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  67.42 
 
 		 359 aa  482  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0775  tartrate dehydrogenase  67.96 
 
 		 359 aa  484  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.731125  normal  0.188776 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3035  tartrate dehydrogenase  64.89 
 
 		 357 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.931781 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5538  tartrate dehydrogenase  68.26 
 
 		 367 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1028  tartrate dehydrogenase  65.1 
 
 		 377 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5903  tartrate dehydrogenase  68.26 
 
 		 367 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  66.48 
 
 		 359 aa  478  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  65.92 
 
 		 359 aa  474  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2247  tartrate dehydrogenase  65.64 
 
 		 361 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141085  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1788  tartrate dehydrogenase  64.54 
 
 		 361 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  64.72 
 
 		 363 aa  471  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  64.79 
 
 		 363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4999  tartrate dehydrogenase  63.26 
 
 		 357 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  62.85 
 
 		 357 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0404  tartrate dehydrogenase  64.07 
 
 		 332 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  60.17 
 
 		 358 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  59.05 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  58.77 
 
 		 354 aa  408  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  56.23 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  54.62 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  55.37 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  54.24 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  55.46 
 
 		 349 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  54.24 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  53.5 
 
 		 363 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  54.24 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  52.1 
 
 		 352 aa  364  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.4 
 
 		 351 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  48.87 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1445  tartrate dehydrogenase  50 
 
 		 358 aa  342  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  51.15 
 
 		 370 aa  341  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4658  tartrate dehydrogenase  48.34 
 
 		 358 aa  335  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0770  tartrate dehydrogenase  48.9 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144909 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9120  tartrate dehydrogenase  48.89 
 
 		 362 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5565  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  48.61 
 
 		 357 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.68 
 
 		 347 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4630  tartrate dehydrogenase  48.32 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6783  tartrate dehydrogenase  48.07 
 
 		 358 aa  328  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>